From e6af618ab1c6f50fd4eb5da9686de21a19ffbdbd Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Charles Plessy Date: Mon, 9 May 2011 06:56:35 +0900 Subject: [PATCH] GBrowse est dans Debian. --- "Debian/debi\303\242neries/gbrowse.mdwn" | 33 ++++++++++++++++++++++++ 1 file changed, 33 insertions(+) create mode 100644 "Debian/debi\303\242neries/gbrowse.mdwn" diff --git "a/Debian/debi\303\242neries/gbrowse.mdwn" "b/Debian/debi\303\242neries/gbrowse.mdwn" new file mode 100644 index 00000000..c2f1d221 --- /dev/null +++ "b/Debian/debi\303\242neries/gbrowse.mdwn" @@ -0,0 +1,33 @@ +[[!meta date="lundi 9 mai 2011, 06:14:06 (UTC+0900)"]] +[[!meta updated="lundi 9 mai 2011, 06:14:06 (UTC+0900)"]] +[[!tag Debian brouillon]] + +[[!meta title="GBrowse arrive dans Debian"]] + +[[http://gbrowse.org|GBrowse]], un navigateur de génomes, est [[!debpkg gbrowse +desc="empaqueté"]] pour GBrowse est une Debian depuis trois semaines. C'est +l'aboutissement d'un travail commencé il y a [[!debbugs 429610 +description="quatre ans"]], et je remercie tout particulèrement Olivier Sallou +pour avoir débloqué et fini le projet à un moment où je commencait à tourner en +rond, et Aaron M. Ucko pour avoir [[!debbugs 624130 description="réparé"]] le +paquet, qui n'était pas compatible avec notre ferme de construction. + +GBrowse et les logiciels de la même famille, comme [[!debpkg igv desc="IGV"]], +permettent de représenter graphiquement un chromosome et ses annotations, comme +la position des gènes et les marqueurs de leur activité, en particulier le +résultat d'expériences utilisant le séquençage d'ADN à haut débit. Une +[[http://debian-med.alioth.debian.org/tasks/bio-ngs tâche Debian]] Med existe +d'ailleurs pour rassembler les programmes utiles dans ce domaine. + +D'ici quelques années, il n'est pas impossible que chaque personne qui le +souhaite puisse faire séquencer ses chromosomes, c'est à dire son génome. Cela +va révolutionner la médecine — et peut-être briser quelques mythes fondateurs. +Même si les logiciels pour le grand public auront certainement une apparence +différente, les paquets comme [[!debpkg gbrowse]] sont un premier pas vers un +meilleur accès pour le public à ses données médicales. + +Le travail continue, avec pour but de pouvoir installer GBrowse et une version +de référence du génome humain avec une commande come apt-get install +human-genome. La prochaine étape sera de mettre à jour [[!debpkg +gbrowse bioperl desc="BioPerl"]], que GBrowse utilise, à la version +[[http://news.open-bio.org/news/2011/04/bioperl-1-6-9-released 1.6.9]]. -- 2.47.3