]> source.charles.plessy.org Git - source/.git/commitdiff
Pendant que LabDroid travaille...
authorCharles <charles.plessy@oist.jp>
Fri, 5 Jul 2019 06:38:21 +0000 (15:38 +0900)
committerCharles <charles.plessy@oist.jp>
Fri, 5 Jul 2019 06:38:21 +0000 (15:38 +0900)
biblio/12915488.mdwn [new file with mode: 0644]
tags/mitochondrion.mdwn

diff --git a/biblio/12915488.mdwn b/biblio/12915488.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..0cd3248
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="Transcript mapping and genome annotation of ascidian mtDNA using EST data."]]
+[[!tag mitochondrion]]
+
+Genome Res. 2003 Sep;13(9):2203-12. doi:10.1101/gr.1227803
+
+Gissi C, Pesole G.
+
+Transcript mapping and genome annotation of ascidian mtDNA using EST data.
+
+[[!pmid 12915488 desc="Observation of polycistronic precursor and mature RNAs in ascidians."]]
index 7c9a5b69f76f562bcafba170ae33c5f9255d3e9e..ebde925a2f97b2fce5720812b1e3cf31e3a7961d 100644 (file)
@@ -1,14 +1,14 @@
 [[!meta title="pages tagged mitochondrion"]]
 
-The ascidian genetic code
--------------------------
+The tunicate mitochondrial genome
+---------------------------------
+
+### Genetic code
 
 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/taxonomyhome.html/index.cgi?chapter=cgencodes#SG13
 
 https://en.wikipedia.org/wiki/Ascidian_mitochondrial_code
 
-(work in progress)
-
  - [[Yokobori and coll, 1993|biblio/8381878]] sequenced _cox1_ in
    _Halocynthia roretzi_ and suggested that it may use a different
    genetic code.  The same year, [[Durrheim and coll. |biblio/8393993]] made
@@ -29,11 +29,17 @@ https://en.wikipedia.org/wiki/Ascidian_mitochondrial_code
  - Another case, unrelated, of reassignment to glycin is know: UGA -> Gly in
    SR1 bacteria ([[Campbell and coll, 2013|biblio/23509275]]).
 
+### Gene order
+
  - _cox2_ and _cytb_ are usually adjascent in tunicates, but they were found
    to be separated in the ascidians _Herdmania momus_ ([[Singh and coll,
    2009|biblio/19922605]]) or _Lissoclinum patella_ ([[Kwan and coll,
    2014|biblio/24788869]]).
 
-To read: Durrheim/8393993 (P. stol code),  Gissi/12915488 (alt. start codon)
+### Transcription
+
+ - EST data shows the presence of polycistronic precursor and mature RNAs
+   ([[Gissi & Pessole, 2003|biblio/12915488]]).
+
 
 [[!inline pages="tagged(mitochondrion)" limit=0]]