]> source.charles.plessy.org Git - source.git/commitdiff
Café
authorCharles <charles.plessy@oist.jp>
Tue, 13 Apr 2021 04:15:18 +0000 (13:15 +0900)
committerCharles <charles.plessy@oist.jp>
Tue, 13 Apr 2021 04:15:18 +0000 (13:15 +0900)
biblio/33828295.mdwn [new file with mode: 0644]
tags/centromere.mdwn

diff --git a/biblio/33828295.mdwn b/biblio/33828295.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..7353abf
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="The structure, function and evolution of a complete human chromosome 8."]]
+[[!tag centromere]]
+
+Nature. 2021 Apr 7. doi:10.1038/s41586-021-03420-7
+
+Logsdon GA, Vollger MR, Hsieh P, Mao Y, Liskovykh MA, Koren S, Nurk S, Mercuri L, Dishuck PC, Rhie A, de Lima LG, Dvorkina T, Porubsky D, Harvey WT, Mikheenko A, Bzikadze AV, Kremitzki M, Graves-Lindsay TA, Jain C, Hoekzema K, Murali SC, Munson KM, Baker C, Sorensen M, Lewis AM, Surti U, Gerton JL, Larionov V, Ventura M, Miga KH, Phillippy AM, Eichler EE.
+
+The structure, function and evolution of a complete human chromosome 8.
+
+[[!pmid 33828295 desc="Nanopore ultra-long reads barcoded with singly unique nucleotide k-mers (SUNKs) of length 20 and assembled.  Sequence was then corrected with HiFi PacBio reads bearing the same k-mer barcodes.  The centromere was assembled with 11 ultra-long reads.  5 different evolutionary strates were found."]]
index 6a3d6ca9d630b5253a2cc31ae03ff168e1036404..d3c212c0110c77aad94599258168952ffb316d73 100644 (file)
@@ -24,5 +24,7 @@ _Work in progress_
    2020|biblio/31958060]].
  - Centromere relocation to a transcribed region in yeast, detected by ChIP of
    centromeric H3 [[Ola and coll., 2020|biblio/32424070]].
+ - 5 evolutionary strates were found in human chr8 centromere ([[Logdson and
+   coll, 2021|biblio/33828295]]).
 
 [[!inline pages="tagged(centromere)" limit="0"]]