]> source.charles.plessy.org Git - source/.git/commitdiff
Café
authorCharles <charles.plessy@oist.jp>
Wed, 24 Feb 2021 07:09:23 +0000 (16:09 +0900)
committerCharles <charles.plessy@oist.jp>
Wed, 24 Feb 2021 07:09:23 +0000 (16:09 +0900)
biblio/29182778.mdwn [new file with mode: 0644]
tags/LAST.mdwn

diff --git a/biblio/29182778.mdwn b/biblio/29182778.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..56d7294
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="Jointly aligning a group of DNA reads improves accuracy of identifying large deletions."]]
+[[!tag LAST]]
+
+Shrestha AMS, Frith MC, Asai K, Richard H.
+
+Nucleic Acids Res. 2018 Feb 16;46(3):e18. doi:10.1093/nar/gkx1175
+
+Jointly aligning a group of DNA reads improves accuracy of identifying large deletions.
+
+[[!pmid 29182778 desc="For short reads."]]
index c6fbd8f4cf1e4eea10a0696ddccab5a893235598..fc0a0dfaef9ae011802794dc517de5cc1c0496f0 100644 (file)
@@ -24,4 +24,6 @@ _bibliography in progress..._
  - LAST can align DNA sequences to protein databases using a 64 x 21 substitution
    matrix [[Yao and Frith, 2020|biblio/10.1101_2021.01.25.428050]].
 
+ - JRA (Joint Read Alignment) uses LAST [[Shrestha and coll., 2018|biblio/29182778]].
+
 [[!inline pages="tagged(LAST)" actions="no" limit=0]]