]> source.charles.plessy.org Git - source/.git/commitdiff
GBrowse est dans Debian.
authorCharles Plessy <https://launchpad.net/~plessy>
Sun, 8 May 2011 21:56:35 +0000 (06:56 +0900)
committerCharles Plessy <https://launchpad.net/~plessy>
Sun, 8 May 2011 21:56:35 +0000 (06:56 +0900)
Debian/debiâneries/gbrowse.mdwn [new file with mode: 0644]

diff --git a/Debian/debiâneries/gbrowse.mdwn b/Debian/debiâneries/gbrowse.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..c2f1d22
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,33 @@
+[[!meta date="lundi 9 mai 2011, 06:14:06 (UTC+0900)"]]
+[[!meta updated="lundi 9 mai 2011, 06:14:06 (UTC+0900)"]]
+[[!tag Debian brouillon]]
+
+[[!meta title="GBrowse arrive dans Debian"]]
+
+[[http://gbrowse.org|GBrowse]], un navigateur de génomes, est [[!debpkg gbrowse
+desc="empaqueté"]] pour GBrowse est une Debian depuis trois semaines.  C'est
+l'aboutissement d'un travail commencé il y a [[!debbugs 429610
+description="quatre ans"]], et je remercie tout particulèrement Olivier Sallou
+pour avoir débloqué et fini le projet à un moment où je commencait à tourner en
+rond, et Aaron M. Ucko pour avoir [[!debbugs 624130 description="réparé"]] le
+paquet, qui n'était pas compatible avec notre ferme de construction.
+
+GBrowse et les logiciels de la même famille, comme [[!debpkg igv desc="IGV"]],
+permettent de représenter graphiquement un chromosome et ses annotations, comme
+la position des gènes et les marqueurs de leur activité, en particulier le
+résultat d'expériences utilisant le séquençage d'ADN à haut débit.  Une
+[[http://debian-med.alioth.debian.org/tasks/bio-ngs tâche Debian]] Med existe
+d'ailleurs pour rassembler les programmes utiles dans ce domaine.
+
+D'ici quelques années, il n'est pas impossible que chaque personne qui le
+souhaite puisse faire séquencer ses chromosomes, c'est à dire son génome.  Cela
+va révolutionner la médecine — et peut-être briser quelques mythes fondateurs.
+Même si les logiciels pour le grand public auront certainement une apparence
+différente, les paquets comme [[!debpkg gbrowse]] sont un premier pas vers un
+meilleur accès pour le public à ses données médicales.
+
+Le travail continue, avec pour but de pouvoir installer GBrowse et une version
+de référence du génome humain avec une commande come <code>apt-get install
+human-genome</code>.  La prochaine étape sera de mettre à jour [[!debpkg
+gbrowse bioperl desc="BioPerl"]], que GBrowse utilise, à la version
+[[http://news.open-bio.org/news/2011/04/bioperl-1-6-9-released 1.6.9]].