]> source.charles.plessy.org Git - setup/.git/commitdiff
Café
authorCharles <charles.plessy@oist.jp>
Mon, 31 May 2021 04:54:02 +0000 (13:54 +0900)
committerCharles <charles.plessy@oist.jp>
Mon, 31 May 2021 04:54:02 +0000 (13:54 +0900)
biblio/20052388.mdwn [new file with mode: 0644]
tags/Ciona.mdwn
tags/speciation.mdwn

diff --git a/biblio/20052388.mdwn b/biblio/20052388.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..7d66f3d
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="How fast is the sessile ciona?"]]
+[[!tag Ciona speciation]]
+
+Berná L, Alvarez-Valin F, D'Onofrio G.
+
+Comp Funct Genomics. 2009;2009:875901. doi:10.1155/2009/875901
+
+How fast is the sessile ciona?
+
+[[!pmid 20052388 desc="“Tajima’s test results [...] for the great majority of the alignments, _Ciona_ genes evolve faster than those of all vertebrate groups[...].”  “On the average, _Ciona_ evolves 50% faster than all vertebrates, with the exception of _O. anatinus_ and _M. domestica_.”  “The divergence between _C. intestinalis_ and _C. savignyi_ was reestimated and found to took place ~184 (±15) My ago.”"]]
index aa1838e7fb7538fcde711da9930c2363dcda3599..558733148c9a5d7d7ec09dc8d0e7a39ca770b6da 100644 (file)
@@ -9,8 +9,11 @@
 
 _C. intestinalis_ and _C. savignyi_ can cross-fertilise after removal of the
 vitelline enveloppe ([[Byrd and Lambert, 2000|biblio/10602281]]).  They are
-estimated to have diverged 122 ± 33 million years ago ([[Delsuc and coll.,
-2018|biblio/29653534]]).
+estimated to have diverged ~184 (±15) My ago based on protein sequence
+comparisons and estimation of the acceleration of the molecular clock in
+tunicates [[Berná, Alvarez-Valin and D'Onofrio, 2009|biblio/20052388]] or
+122 ± 33 million years ago based on sequence analysis of 258 proteins from 63
+species ([[Delsuc and coll., 2018|biblio/29653534]]).
 
 _Ciona robusta_'s sperm can efficiently fertilise _C. intestinalis_ eggs, but
 the fertilisation rates are much lower in the reciprocal crosses ([[Suzuki,
index 240b8e82ad547657f81375f58c696b11747c0c5f..8c73eea3a0fe383a5bb638c42d18178035da45c3 100644 (file)
@@ -1,4 +1,3 @@
 [[!meta title="pages tagged speciation"]]
 
-[[!inline pages="tagged(speciation)" actions="no" archive="yes"
-feedshow=10]]
+[[!inline pages="tagged(speciation)" limit=0]]