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LAVA elements.
authorCharles <charles.plessy@oist.jp>
Wed, 27 Nov 2019 03:25:00 +0000 (12:25 +0900)
committerCharles <charles.plessy@oist.jp>
Wed, 27 Nov 2019 03:25:00 +0000 (12:25 +0900)
biblio/25209798.mdwn

index 0c95e81050a1407e6438a8ca7eb14736f79393c2..487e4fafdb6fcb81e695bd3d2e5d4f11be541ad0 100644 (file)
@@ -1,5 +1,5 @@
 [[!meta title="Gibbon genome and the fast karyotype evolution of small apes."]]
-[[!tag chromosome synteny evolution]]
+[[!tag chromosome synteny evolution repeat]]
 
 Carbone L, Harris RA, Gnerre S, Veeramah KR, Lorente-Galdos B, Huddleston J,
 Meyer TJ, Herrero J, Roos C, Aken B, Anaclerio F, Archidiacono N, Baker C,
@@ -20,4 +20,4 @@ Nature. 2014 Sep 11;513(7517):195-201. doi:10.1038/nature13679
 
 Gibbon genome and the fast karyotype evolution of small apes.
 
-[[!pmid 25209798 desc="“We identified 96 gibbon–human synteny breakpoints in Nleu1.0.”  “Segmental duplication enrichment was the best predictor of gibbon–human synteny breakpoints,[...] however, breakpoints were also enriched for Alu elements.”  “ The majority of gibbon chromosomal breakpoints bore signatures of non-homology based mechanisms.” “We observed an enrichment of gibbon–human breakpoints in CTCF-binding events.”"]]
+[[!pmid 25209798 desc="“We identified 96 gibbon–human synteny breakpoints in Nleu1.0.”  “Segmental duplication enrichment was the best predictor of gibbon–human synteny breakpoints,[...] however, breakpoints were also enriched for Alu elements.”  “ The majority of gibbon chromosomal breakpoints bore signatures of non-homology based mechanisms.” “We observed an enrichment of gibbon–human breakpoints in CTCF-binding events.”  Insertion of LAVA (3'-L1-AluS-VNTR-Alu-like-5') elements in genes related to cell division might have caused the accelerated evolution of the karyotype in gibbons."]]