]> source.charles.plessy.org Git - source/.git/commitdiff
Café
authorCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Fri, 17 Dec 2021 04:11:10 +0000 (13:11 +0900)
committerCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Fri, 17 Dec 2021 04:11:10 +0000 (13:11 +0900)
biblio/19936241.mdwn [new file with mode: 0644]
tags/Drosophila.mdwn
tags/variants.mdwn

diff --git a/biblio/19936241.mdwn b/biblio/19936241.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..4691eb1
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="The transposon Galileo generates natural chromosomal inversions in Drosophila by ectopic recombination."]]
+[[!tag Drosophila repeat variants]]
+
+Delprat A, Negre B, Puig M, Ruiz A.
+
+PLoS One. 2009 Nov 18;4(11):e7883. doi:10.1371/journal.pone.0007883
+
+The transposon Galileo generates natural chromosomal inversions in Drosophila by ectopic recombination.
+
+[[!pmid 19936241 desc="In _D. buzzatii_, the 2z(3) inversion is flanked by several transposable elements, among which two Galileo repeats (cut-and-paste mechanism, members of the P element family), that “(i) are inserted in opposite orientation; (ii) present exchanged target site duplications; and (iii) are both chimeric”, suggesting ectopic recombination."]]
index b4ecf0d4ad39e7a578751f1298018bf4db94adeb..3e2143f988597cb99f25fe9b814caba4c5012555 100644 (file)
@@ -43,4 +43,7 @@ See also [[Muller elements|muller_element]].
 _D. melanogaster_'s development time course at different temperatures was fitted
 to the Arrhenius law in [[Crapse and coll., 2021|biblio/34414660]].
 
+Ectopic recombination of a Galileo element may have caused a recent large-scale
+inversion in _D. buzzati_ ([[Delprat and coll, 2009|biblio/19936241]]).
+
 [[!inline pages="tagged(Drosophila)" limit=0]]
index 9bc58e5773492b0ea6b8a6a3d2f6dc0f769f9fe7..75e312bd3dfcff0028890236b7a67bb46b43cd28 100644 (file)
@@ -35,6 +35,9 @@ vicinity.  [[Donelly and coll., 2010|biblio/20116045]] gave a radically lower
 time estimate of 13,600 to 108,400 years, but an ancient origin was again
 supported by [[Steinberg and coll in 2012|biblio/22751100]].
 
+Ectopic recombination of a Galileo element may have caused a recent large-scale
+inversion in _D. buzzati_ ([[Delprat and coll, 2009|biblio/19936241]]).
+
 ### Software
 
  - _NanoSV_ ([[Cretu Stancu and coll., 2017|biblio/29109544]]) uses nanopore long