]> source.charles.plessy.org Git - source++/.git/commitdiff
Café
authorCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Tue, 18 Oct 2022 03:59:54 +0000 (12:59 +0900)
committerCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Tue, 18 Oct 2022 03:59:54 +0000 (12:59 +0900)
biblio/16120641.mdwn [new file with mode: 0644]
tags/Oikopleura.mdwn

diff --git a/biblio/16120641.mdwn b/biblio/16120641.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..15f19e5
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="The evolutionary history of placodes: a molecular genetic investigation of the larvacean urochordate Oikopleura dioica."]]
+[[!tag Oikopleura olfaction]]
+
+Bassham S, Postlethwait JH.
+
+Development. 2005 Oct;132(19):4259-72. doi:10.1242/dev.01973
+
+The evolutionary history of placodes: a molecular genetic investigation of the larvacean urochordate _Oikopleura dioica_.
+
+[[!pmid 16120641 desc="Animals fed with algal concentrates.  _O. dioica_ has one orthologue of _eyes absent_, _Eya_, and one orthologue of the vertebrate _Pitx_ genes, with multiple promoters and alternative splice sites, and lacking an OAR domain.  It has three _sine oculis_ orthologues, _Six1/2_, _Six3/6a_ and _Six3/6b.  They are not clustered like vertebrate genes, but the two _Six3/6_ share an intron position in their homeodomain.  Expression pattern of these genes support the hypothesis that _O. dioica_ has a placode that is homologous to the vertebrate olfactory placode."]]
index 0bc923fee0f7f737a5a3222559d87cf4ad80ea66..a81e4dc685aca745b6819d841a413e2c396c9d13 100644 (file)
@@ -258,6 +258,8 @@ Genes and pathways
  - _O. dioica_ has the miRNA machinery and some miRNAs such as _let-7a_ were detected.  36 % of
    the miRNAs had a length of 22 nt in [[Fu, Adamski and Thompson, 2008|biblio/18339653]].
  - 6 FGF genes were detected by Oulion, Bertrand and Escriva ([[2012|biblio/22919541]]).
+ - _Eya_, _Pitx_, _Six1/2_, _Six3/6a_ and _Six3/6b_, with expression patterns supporting
+   homology of larvacean and vertebrate placodes ([[Bassham and Postlethwait, 2005|biblio/16120641]]).
 
 ### Lost