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EcoP15I.
authorCharles Plessy <https://launchpad.net/~plessy>
Tue, 5 Jul 2011 10:25:48 +0000 (19:25 +0900)
committerCharles Plessy <https://launchpad.net/~plessy>
Tue, 5 Jul 2011 10:25:48 +0000 (19:25 +0900)
biblio/14676315.mdwn [new file with mode: 0644]
biblio/16026759.mdwn
biblio/19250940.mdwn
biblio/20435912.mdwn [new file with mode: 0644]
biblio/7796821.mdwn [new file with mode: 0644]
biblio/To_Do

diff --git a/biblio/14676315.mdwn b/biblio/14676315.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..03705a2
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,3 @@
+[[!meta title="Gene expression analysis of plant host-pathogen interactions by SuperSAGE."]]
+[[!tag sequence_tags SAGE method EcoP15I enzyme]
+[[!pmid 14676315 desc="Uses the class III enzyme EcoP15I to get longer tags."]]
index 26c9c1f7afc884b86e387f0fd693f3e791ba6249..e40efad3d1cfb4bd277038e25cc1df07431c51fe 100644 (file)
@@ -1,3 +1,3 @@
 [[!meta title="Exogenous AdoMet and its analogue sinefungin differentially influence DNA cleavage by R.EcoP15I--usefulness in SAGE."]]
-[[!tag enzyme products method sequence_tags]]
+[[!tag EcoP15I enzyme products method sequence_tags]]
 [[!pmid 16026759 desc="Sinefungin promotes cleavage of the DNA molecules even if they contain only one EcoP15I site."]]
index 7ef8a9a29e4063f18c2817ec4ccc6ebfe6c14fb7..7fa9b352f463d407520bfd1eb83b4c5dde705020 100644 (file)
@@ -1,3 +1,3 @@
 [[!meta title="Functional Characterization and Modulation of the DNA Cleavage Efficiency of Type III Restriction Endonuclease EcoP15I in Its Interaction with Two Sites in the DNA Target."]]
-[[!tag enzyme products sequence_tags]]
-[[!pmid 19250940 desc="“Adenine stretches on the 5' or 3' side of CAGCAG led to preferred cleavage of this site.”"]]
+[[!tag EcoP15I enzyme products sequence_tags]]
+[[!pmid 19250940 desc="“Adenine stretches on the 5′ or 3′ side of CAGCAG led to preferred cleavage of this site.”"]]
diff --git a/biblio/20435912.mdwn b/biblio/20435912.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..d45705f
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,3 @@
+[[!meta title="Type III restriction enzymes cleave DNA by long-range interaction between sites in both head-to-head and tail-to-tail inverted repeat"]]
+[[!tag EcoP15I enzyme]]
+[[!pmid 20435912 desc="Measures kinetics using single molecule imaging."]]
diff --git a/biblio/7796821.mdwn b/biblio/7796821.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..0647d7b
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,3 @@
+[[!meta title="Type III restriction endonucleases translocate DNA in a reaction driven by recognition site-specific ATP hydrolysis."]]
+[[!tag EcoP15I enzyme]]
+[[!pmid 7796821 desc="Protein bound to the DNA between the EcoP15I sites interfers negatively with cleavage."]]
index 4b9446e428e851af1de12ea3801168034b964d39..c93d78e88037bac86604931e145507dc252c0f38 100644 (file)
@@ -669,12 +669,6 @@ The ultraconserved elements in the Irx clusters are transcription enhancers.
 15037782 [enzymes]
 The adenylation of RNA by T4 RNL1 is enhanced when they are annealed to a DNA oligos, leaving 3-4 protruding 5'ribonucleotides.
 
-7796821 [enzymes]
-Protein bound to the DNA between the EcoP15I interfer negatively with cleavage.
-
-14676315 [tags]
-Uses the class III enzyme EcoP15I to get longer tags.
-
 15899965 [enhancers]
 Out of 126 ultraconserved elements in a melanogaster / A. Gambiae comparison, only 1 is intergenic, the other being mostly ncRNA and exons.