]> source.charles.plessy.org Git - source.git/commitdiff
Café
authorCharles Plessy <plessy@riken.jp>
Thu, 17 May 2018 06:52:40 +0000 (15:52 +0900)
committerCharles Plessy <plessy@riken.jp>
Thu, 17 May 2018 06:52:40 +0000 (15:52 +0900)
biblio/20598146.mdwn [new file with mode: 0644]
tags/template_switching.mdwn

diff --git a/biblio/20598146.mdwn b/biblio/20598146.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..9aa458f
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="Incorporation of non-natural nucleotides into template-switching oligonucleotides reduces background and improves cDNA synthesis from very small RNA samples."]]
+[[!tag template_switching reverse_transcription]]
+
+BMC Genomics. 2010 Jul 2;11:413. doi:10.1186/1471-2164-11-413
+
+Kapteyn J, He R, McDowell ET, Gang DR.
+
+Incorporation of non-natural nucleotides into template-switching oligonucleotides reduces background and improves cDNA synthesis from very small RNA samples.
+
+[[!pmid 20598146 desc="TSO starting with iCiGiC (iso-dC / iso-dG) does not form concatenates because the RTase is inhibited by these nucleotides, therefore it does not reach the end and no extra template switching occurs."]]
index e7f8577af1562872091ff195222a20a710d4a66a..5c3a1090ff092d1264fee37c9b689a18e57f9e91 100644 (file)
@@ -47,6 +47,10 @@ as a replacement for RNA.
  - 3′ phosphate or biotin blocking groups abolish template-switching
    ([[Turchinovich et al (2014)|biblio/24922482]] and others).
 
+ - 5′ iso-dC and iso-dG prevents reverse-transcriptase to reach the end
+   of the TSO, and therefore blocks concatenation
+   ([[Kapteyn et al., 2010|biblio/20598146]]).
+
 ### Effect of TSO concentration
 
  - For the STRT method, [[Zajac et al (2013)|biblio/24392002]] concluded that