]> source.charles.plessy.org Git - source/.git/commitdiff
dnarrange tutorial
authorCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Tue, 13 Dec 2022 07:21:50 +0000 (16:21 +0900)
committerCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Tue, 13 Dec 2022 07:21:50 +0000 (16:21 +0900)
biblio/10.1101_2022.05.30.494079.mdwn [new file with mode: 0644]
tags/LAST.mdwn

diff --git a/biblio/10.1101_2022.05.30.494079.mdwn b/biblio/10.1101_2022.05.30.494079.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..85b47e2
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="Finding rearrangements in nanopore DNA reads with last and dnarrange"]]
+[[!tag bioRxiv LAST]]
+
+Martin C. Frith, Satomi Mitsuhashi
+
+Posted August 15, 2022. doi:10.1101/2022.05.30.494079
+
+Finding rearrangements in nanopore DNA reads with last and dnarrange
+
+[[!doi 10.1101/2022.05.30.494079 desc="Tutorial on how to use `dnarrange`.  Examples of gene conversion, repeat insertion in the reference, pseudogene insertion in the query, etc."]]
index 8a7d8a8159aa8aaa66c121a9bebc64d0a22fb4cf..5a360e45ddb874294f386e009d8574581d2809b2 100644 (file)
@@ -37,4 +37,7 @@ _bibliography in progress..._
 
  - JRA (Joint Read Alignment) uses LAST [[Shrestha and coll., 2018|biblio/29182778]].
 
+ - A tutorial for the use of `dnarrange` is published in [[Frith and
+   Mitsuhashi, 2022|biblio/10.1101_2022.05.30.494079]].
+
 [[!inline pages="tagged(LAST)" actions="no" limit=0]]