]> source.charles.plessy.org Git - source.git/commitdiff
ANI
authorCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Fri, 17 Oct 2025 08:32:16 +0000 (17:32 +0900)
committerCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Fri, 17 Oct 2025 08:32:16 +0000 (17:32 +0900)
biblio/30504855.mdwn
biblio/39878503.mdwn [new file with mode: 0644]

index fc8aa412f2c3858da661175f88c03c913effb7e4..78c3736b68d5a195521d7d66167d36104f2b0d2a 100644 (file)
@@ -1,5 +1,5 @@
 [[!meta title="High throughput ANI analysis of 90K prokaryotic genomes reveals clear species boundaries."]]
-[[!tag speciation]]
+[[!tag ANI speciation]]
 
 Nat Commun. 2018 Nov 30;9(1):5114. doi:10.1038/s41467-018-07641-9
 
diff --git a/biblio/39878503.mdwn b/biblio/39878503.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..20d2c49
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="Exploration of the genetic landscape of bacterial dsDNA viruses reveals an ANI gap amid extensive mosaicism."]]
+[[!tag ANI speciation]]
+
+Ndovie W, Havránek J, Leconte J, Koszucki J, Chindelevitch L, Adriaenssens EM, Mostowy RJ.
+
+Exploration of the genetic landscape of bacterial dsDNA viruses reveals an ANI gap amid extensive mosaicism.
+
+mSystems. 2025 Feb 18;10(2):e0166124. doi:10.1128/msystems.01661-24
+
+[[!pmid 39878503 desc="“revealed a multimodal ANI distribution, with a distinct gap around 80%, akin to the bacterial ANI gap (~90%)”  “accuracy and scalability compared to existing approaches, even to data sets of hundreds of thousands of viral genomes”"]]