]> source.charles.plessy.org Git - source/.git/commitdiff
Café
authorCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Mon, 20 Jun 2022 05:16:20 +0000 (14:16 +0900)
committerCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Mon, 20 Jun 2022 05:16:20 +0000 (14:16 +0900)
biblio/10331260.mdwn [new file with mode: 0644]
biblio/35658077.mdwn [new file with mode: 0644]
tags/trans-splicing.mdwn

diff --git a/biblio/10331260.mdwn b/biblio/10331260.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..d79ef5e
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="Evolutionary instability of operon structures disclosed by sequence comparisons of complete microbial genomes."]]
+[[!tag operon]]
+
+Itoh T, Takemoto K, Mori H, Gojobori T.
+
+Mol Biol Evol. 1999 Mar;16(3):332-46. doi:10.1093/oxfordjournals.molbev.a026114
+
+Evolutionary instability of operon structures disclosed by sequence comparisons of complete microbial genomes.
+
+[[!pmid 10331260 desc="Search accross prokaryotes, archea and eukaryotes.  No operon conservation between bacteria and yeast, except perhaps _gal_.  Many operons destroyed in bacteria, although some very conserved ones remain (for instance for ribosomal proteins).  Proposes a partimonious way to estimate operon creation and destruction."]]
diff --git a/biblio/35658077.mdwn b/biblio/35658077.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..4f9c3be
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="Repeated translocation of a supergene underlying rapid sex chromosome turnover in Takifugu pufferfish."]]
+[[!tag chromosome sex fish]]
+
+Kabir A, Ieda R, Hosoya S, Fujikawa D, Atsumi K, Tajima S, Nozawa A, Koyama T, Hirase S, Nakamura O, Kadota M, Nishimura O, Kuraku S, Nakamura Y, Kobayashi H, Toyoda A, Tasumi S, Kikuchi K.
+
+Proc Natl Acad Sci U S A. 2022 Jun 7;119(23):e2121469119. doi:10.1073/pnas.2121469119
+
+Repeated translocation of a supergene underlying rapid sex chromosome turnover in Takifugu pufferfish.
+
+[[!pmid 35658077 desc="The genome of the green puffer (Takifugu alboplumbeus or T. niphobles) was assembled.  SNP analysis of multiple species showed that in three fugu species (T. niphobles, T. snyderi and T. vermicularis), the sex determination locus is not _Amrh2_ anymore (like it is in T. rubripes), but a new supergene containing _GsdfY_.  This supergene appears to have moved to a new autosome more than once in the evolutionary history of these species."]]
index b1a06e158e6bfb2bc1a5db3d87336fe220ab7dbd..c400097660edae0835bdc5ec68029151b336c24f 100644 (file)
@@ -1,5 +1,7 @@
 [[!meta title="pages tagged trans-splicing"]]
 
+_Also check the [[operon]] tag..._
+
 Trans-spplicing of a splice leader from a nematode and a trypanosome was shown
 to be possible in COS cells and HeLa cell extracts by [[Bruzik and Maniatis, 1992|biblio/1465136]].