]> source.charles.plessy.org Git - source/.git/commitdiff
Café
authorCharles <charles.plessy@oist.jp>
Thu, 16 Jul 2020 04:01:25 +0000 (13:01 +0900)
committerCharles <charles.plessy@oist.jp>
Thu, 16 Jul 2020 04:01:25 +0000 (13:01 +0900)
biblio/31036053.mdwn [new file with mode: 0644]

diff --git a/biblio/31036053.mdwn b/biblio/31036053.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..f1b6c7c
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title=""]]
+[[!tag sequence_tag bias]]
+
+Measuring sequencer size bias using REcount: a novel method for highly accurate Illumina sequencing-based quantification.
+
+Gohl DM, Magli A, Garbe J, Becker A, Johnson DM, Anderson S, Auch B, Billstein B, Froehling E, McDevitt SL, Beckman KB.
+
+Genome Biol. 2019 Apr 29;20(1):85. doi:10.1186/s13059-019-1691-6
+
+[[!pmid 31036053 desc="Sequencing templates already containing full Illumina adapters are cleaved from plasmids with a type IIS enzyme that generates blunt ends.  Comparison between fixed-length and variable-length payloads allowed to study the size bias in Illumina sequencers.  NextSeq > iSeq > MiSeq > NovaSeq.  A freeze-thaw cycle reduced the prevalence of the smallest templates (~150 bp)."]]