]> source.charles.plessy.org Git - source--/.git/commitdiff
Corrections
authorCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Fri, 15 Apr 2022 06:31:01 +0000 (15:31 +0900)
committerCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Fri, 15 Apr 2022 06:31:01 +0000 (15:31 +0900)
tags/LAST.mdwn

index 8157f372b65e5bf75f86138502bd31b1b6a59e1f..8a7d8a8159aa8aaa66c121a9bebc64d0a22fb4cf 100644 (file)
@@ -5,7 +5,7 @@ _bibliography in progress..._
  - Whole-genome alignments with reversed sequences as negative controls showed
    that e-value filtering is not enough to remove spurious alignments of tandem
    repeat which therefore need to be masked ([[Frith MC, Hamada M and Horton P.,
-   2011|bilbio/20144198]]).
+   2011|biblio/20144198]]).
 
  - `lastdb` can use various seeding schemes to build its index.  [[Frith and
    NoĆ© (2014)|biblio/24493737]] discuss some of them.  The `RY` seeds are made
@@ -33,7 +33,7 @@ _bibliography in progress..._
    of expansion of tandem repeats, after alignment with `last-split`.
 
  - LAST can align DNA sequences to protein databases using a 64 x 21 substitution
-   matrix [[Yao and Frith, 2020|biblio/10.1101_2021.01.25.428050]].
+   matrix [[Yao and Frith, 2020|biblio/10.1007_978-3-030-74432-8_11]].
 
  - JRA (Joint Read Alignment) uses LAST [[Shrestha and coll., 2018|biblio/29182778]].