]> source.charles.plessy.org Git - source++/.git/commitdiff
Café
authorCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Tue, 10 May 2022 04:30:59 +0000 (13:30 +0900)
committerCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Tue, 10 May 2022 04:30:59 +0000 (13:30 +0900)
biblio/35508532.mdwn [new file with mode: 0644]
tags/synteny.mdwn

diff --git a/biblio/35508532.mdwn b/biblio/35508532.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..c8a376c
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="Genome and transcriptome mechanisms driving cephalopod evolution."]]
+[[!tag genome synteny]]
+
+Albertin CB, Medina-Ruiz S, Mitros T, Schmidbaur H, Sanchez G, Wang ZY, Grimwood J, Rosenthal JJC, Ragsdale CW, Simakov O, Rokhsar DS.
+
+Nat Commun. 2022 May 4;13(1):2427. doi:10.1038/s41467-022-29748-w
+
+Genome and transcriptome mechanisms driving cephalopod evolution.
+
+[[!pmid 35508532 desc="Most chromosomes of _Doryteuthis pealeii_ have a direct counterpart in _Euprymna scolopes_ and retained visible synteny with the scallop Mizuhopecten yessoensis_.  In both cases, the gene order in syntenic regions is considerably scrambled."]]
index a073079e4f0df91cdbd4c2c112ac79fc2bc6e437..2b5aa9694ff7b9bf036263f7d8b513abf3e9639d 100644 (file)
@@ -51,6 +51,9 @@ but not other fungi such as yeast, “genes are conserved within homologous
 chromosomes, but with randomized orders and orientations“ and call that
 phenomenon “mesosynteny”.
 
+Squid chromosomes still have synteny with scallop, but gene order is scrambled
+([[Albertin and coll., 2022|biblio/35508532]]).
+
 ### Ancestral karyotpyes
 
  - The ancestral mammalian genome has 30 chromosomes ([[Zhou and coll., 2021|biblio/33408411]]).