]> source.charles.plessy.org Git - source++/.git/commitdiff
outliers
authorCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Thu, 27 Apr 2023 09:19:31 +0000 (18:19 +0900)
committerCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Thu, 27 Apr 2023 09:19:31 +0000 (18:19 +0900)
biblio/22925495.mdwn [new file with mode: 0644]
tags/chromosome.mdwn

diff --git a/biblio/22925495.mdwn b/biblio/22925495.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..6669e60
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="Gene functionalities and genome structure in Bathycoccus prasinos reflect cellular specializations at the base of the green lineage."]]
+[[!tag genome chromosome repeats]]
+
+Moreau H, Verhelst B, Couloux A, Derelle E, Rombauts S, Grimsley N, Van Bel M, Poulain J, Katinka M, Hohmann-Marriott MF, Piganeau G, Rouzé P, Da Silva C, Wincker P, Van de Peer Y, Vandepoele K.
+
+Genome Biol. 2012 Aug 24;13(8):R74. doi:10.1186/gb-2012-13-8-r74
+
+Gene functionalities and genome structure in Bathycoccus prasinos reflect cellular specializations at the base of the green lineage.
+
+[[!pmid 22925495 desc="7,847 genes, no transposons.  Two “outlier” chromosomes are found with lower GC content, like in _Ostreococcus_ and _Micromonas_.  Genes in the big outlier chromosomes have a high number of small AT-rich introns with no apparent conserved motifs."]]
index 288710cd86c7e04fa59c6d0b6e885f1dfdb5a15e..ac6a488790ed998151291e93cdf8b3427540d367 100644 (file)
@@ -6,7 +6,9 @@ _in progressss_
 
 Two (out of 20) chromosomes in the genome of the unicellular green alga
 _Ostreococcus tauri_ have a markedly different GC and transposable element
-content compared to the others. [[Derelle et al., 2003|biblio/16868079]].
+content compared to the others. [[Derelle and coll., 2003|biblio/16868079]].
+The same phenomeon has then been reported in _Bathycoccus prasinos_ ([[Moreau
+and coll., 2012|biblio/22925495]]) and other species.
 
 Chr4 in _Polypedilum vanderplanki_ has lower GC content than the others
 ([[Yoshida et al., 2022|biblio/35387384]]), and it has been speculated that it