]> source.charles.plessy.org Git - source.git/commitdiff
trans-splicing
authorCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Thu, 16 Jun 2022 01:24:48 +0000 (10:24 +0900)
committerCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Thu, 16 Jun 2022 01:24:48 +0000 (10:24 +0900)
biblio/20142326.mdwn [new file with mode: 0644]
tags/trans-splicing.mdwn

diff --git a/biblio/20142326.mdwn b/biblio/20142326.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..3a597f2
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="Convergent origins and rapid evolution of spliced leader trans-splicing in metazoa: insights from the ctenophora and hydrozoa."]]
+[[!tag trans-splicing]]
+
+Derelle R, Momose T, Manuel M, Da Silva C, Wincker P, Houliston E.
+
+RNA. 2010 Apr;16(4):696-707. doi:10.1261/rna.1975210
+
+Convergent origins and rapid evolution of spliced leader trans-splicing in metazoa: insights from the ctenophora and hydrozoa.
+
+[[!pmid 20142326 desc="“First evidence for SL trans-splicing in ctenophores.” (_Pleurobrachia pileus_ and _Mnemiopsis leidyi_)  “Analysis of data sets for the hydrozoans _H. magnipapillata_ and _C. hemisphaerica_ revealed a high number of SL sequence variants per species.”  The same gene may use different splice leaders.  An adenosine-rich region is found between the trans-splicing site and the transcription initiation site in hydrozoans, but not in other species (including _Oikopleura_."]]
index 5cfd6dadf8aa8948d11959a5056216033c6beb78..b1a06e158e6bfb2bc1a5db3d87336fe220ab7dbd 100644 (file)
@@ -15,4 +15,9 @@ The splice leader is 16-nt in C. intestinalis ([[Satou et al,
 dioica_ is `TTT(C/T/A)AGA`, which is the same as the cis-splicing acceptor
 with an extra `A` at the end.
 
+Trans-splicing is also found in cnidarians ([[Derelle et al., 2010|biblio/20142326]]).
+
+In hydrozoans, the region between the trans-splicing site and the translation initiation site
+is A-rich ([[Derelle et al., 2010|biblio/20142326]]).
+
 [[!inline pages="tagged(trans-splicing)" actions="no" limit=0]]