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authorCharles Plessy <plessy@riken.jp>
Mon, 5 Feb 2018 08:25:44 +0000 (17:25 +0900)
committerCharles Plessy <plessy@riken.jp>
Mon, 5 Feb 2018 08:25:44 +0000 (17:25 +0900)
biblio/12136033.mdwn [new file with mode: 0644]
biblio/To_Do
tags/power_law.mdwn

diff --git a/biblio/12136033.mdwn b/biblio/12136033.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..0c2efb5
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="General statistics of stochastic process of gene expression in eukaryotic cells."]]
+[[!tag SAGE power_law]]
+
+Kuznetsov VA, Knott GD, Bonner RF.
+
+Genetics. 2002 Jul;161(3):1321-32.
+
+General statistics of stochastic process of gene expression in eukaryotic cells.
+
+[[!pmid 12136033 desc="The distribution of the SAGE tags follow a power law."]]
index d73e64a9ce7d4829c80dffacf150ab2cb525fd64..c387d338d5e56156937e528c948e6c152d1ac137 100644 (file)
@@ -734,9 +734,6 @@ Digests single-stranded 5' phosphorylated DNA or RNA molecules
 14999098 [mining]
 [not read] Power law in microarray data.
 
-12136033 [tags]
-The distribution of the SAGE tags follow a power law.
-
 17936740 [enhancers]
 Another conserved enhancer in a developmental regulator that is not a transcription factor.
 
index 27e846e4aeb0f9a3588e9626a0a8da2818c8d5a4..5d38526313ea6e7f2e3554148c4b84acf98a9d6c 100644 (file)
@@ -1,4 +1,16 @@
 [[!meta title="pages tagged power law"]]
 
-[[!inline pages="tagged(power_law)" actions="no" archive="yes"
-feedshow=10]]
+Power law in high-throughput biology
+====================================
+
+(very parcellar; work in progress).
+
+Reverse-cumulative distribution of SAGE tags was shown by [[Kuznetstov, Knott &
+Bonner (2002)|biblio/12136033]] to follow a power law.  [[Balwierz et al.,
+2009|biblio/19624849]] showed the same for CAGE tags and and implemented a
+normalisation method fitting the data to the power law.
+
+Power laws are also seen in other areas, for instance in parameters describing
+network topologies ([[Barabási & Albert, 1999|biblio/10521342]]).
+
+[[!inline pages="tagged(power_law)" limit=0]]