]> source.charles.plessy.org Git - source.git/commitdiff
Café
authorCharles <charles.plessy@oist.jp>
Mon, 6 Jul 2020 04:57:06 +0000 (13:57 +0900)
committerCharles <charles.plessy@oist.jp>
Mon, 6 Jul 2020 04:57:06 +0000 (13:57 +0900)
biblio/31969429.mdwn [new file with mode: 0644]
tags/Drosophila.mdwn

diff --git a/biblio/31969429.mdwn b/biblio/31969429.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..f48e461
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="Chromosome-Level Assembly of _Drosophila bifasciata_ Reveals Important Karyotypic Transition of the X Chromosome."]]
+[[!tag Hi-C Drosophila genome]]
+
+Bracewell R, Tran A, Chatla K, Bachtrog D.
+
+G3 (Bethesda). 2020 Mar 5;10(3):891-897. doi:10.1534/g3.119.400922
+
+Chromosome-Level Assembly of _Drosophila bifasciata_ Reveals Important Karyotypic Transition of the X Chromosome.
+
+[[!pmid 31969429 desc="Chromosome arms do not interact much with each other.  Large and highly repetitive pericentric regions in which it is hard to map the Hi-C reads."]]
index 5d7fe7f3ef6753362e316b043420b6d22f72383a..bbf3079911e7ebe656cf62ede91fabbb6ae8ce64 100644 (file)
@@ -12,4 +12,7 @@ and Nei  (1995)|biblio/7739381]]) suggests that D. mel and D. pseudoobscura
 diverged 24.9 +/- 2.88 My ago, based on the assumption that D. picticornis and
 D. silvestris diverged 5.1 My ago.
 
+_D. bifasciata_ (and other Drosophila) have large and highly repetitive
+pericentric regions [[Bracewell and coll., 2020|biblio/31969429]]
+
 [[!inline pages="tagged(Drosophila)" limit=0]]