]> source.charles.plessy.org Git - source.git/commitdiff
Old
authorCharles Plessy <plessy@riken.jp>
Fri, 2 Feb 2018 05:28:45 +0000 (14:28 +0900)
committerCharles Plessy <plessy@riken.jp>
Fri, 2 Feb 2018 05:28:45 +0000 (14:28 +0900)
biblio/4609429.mdwn [new file with mode: 0644]
biblio/To_Do
tags/ligase.mdwn

diff --git a/biblio/4609429.mdwn b/biblio/4609429.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..33ec324
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="T4 RNA ligase: substrate chain length requirements."]]
+[[!tag ligase]]
+
+FEBS Lett. 1974 Sep 15;46(1):271-5.
+
+Kaufmann G, Klein T, Littauer UZ.
+
+T4 RNA ligase: substrate chain length requirements.
+
+[[!pmid 4609429 desc="For circularisation, (pA)8 is the shortest substrate, and the reaction is most efficient with (pA)10. The ligation efficicency then decreases with substrate length."]]
index 68e22c225954265d5c8782fdcf5be7ab1a2c4fb4..ed99b9da11135050444d8a4b852b07aa26970ea4 100644 (file)
@@ -353,9 +353,6 @@ Out of 126 ultraconserved elements in a melanogaster / A. Gambiae comparison, on
 7082652 [enzymes]
 T4RNL1 & AMP can  remove or exchange 3' pNp from RNA molecles.
 
-4609429 [enzymes]
-(pA)8 is the smallet substrate, and the reaction is most efficient with (pA)10. The ligation efficicency then decreas with substrate length.
-
 12429865 [tags]
 Provides an easy access to various statistical tests.
 
index d80e08ef66b7f866c00a0e49f3e2dc711012e5b1..51c0ac028330595a15549cc6c37b76d86dd8a931 100644 (file)
@@ -2,6 +2,11 @@
 
 Work in progress.
 
+On T4 RNL1:
+
+ - Using poly-A as substrate for circularisation, minimal length is 8, optimal
+   is 10, and then efficiency decreases slowly [[Kaufmann, Klein & Littauer, 1974|biblio/4609429]].
+
 On T4 RNL2:
 
  - Primary paper: [[Ho et al., 2002|biblio/12228725]].