]> source.charles.plessy.org Git - source/.git/commitdiff
LAST
authorCharles <charles.plessy@oist.jp>
Thu, 4 Apr 2019 04:17:01 +0000 (13:17 +0900)
committerCharles <charles.plessy@oist.jp>
Thu, 4 Apr 2019 04:17:01 +0000 (13:17 +0900)
biblio/25994148.mdwn
tags/LAST.mdwn

index 0f8185f4a540321022b159773c8afdd01faf9661..d353c2b507042a3b4291ebc331a049f3849d7b50 100644 (file)
@@ -7,4 +7,4 @@ Genome Biol. 2015 May 21;16:106. doi:10.1186/s13059-015-0670-9
 
 Split-alignment of genomes finds orthologies more accurately.
 
-[[!pmid 25994148 desc="Optimal set of local alignments.  Striking example of intra-chromosomal loss of synteny between D. melanogaster and D. pseudoobscura."]]
+[[!pmid 25994148 desc="Optimal set of local alignments.  Striking example of intra-chromosomal loss of synteny between D. melanogaster and D. pseudoobscura.  Heuristic approach inspired by the “repeated matches algorithm” of Durbin and coll., 1998."]]
index 12a6a69fb191a9a0183b17e63a18794ae52b484b..b2682b5b92e290f05560c284cd8fa65c549cd30c 100644 (file)
@@ -1,4 +1,11 @@
 [[!meta title="pages tagged LAST"]]
 
-[[!inline pages="tagged(LAST)" actions="no" archive="yes"
-feedshow=10]]
+_bibliography in progress..._
+
+ - `last-split` [[Frith and Kawaguchi, 2017|biblio/25994148]]: heuristic
+   algorithm inspired by the “repeated matches algorithm” of Durbin and coll
+   (1998).
+
+ - `last-train` [[|Hamada, Ono, Asai and Frith, 2017biblio/28039163]]: estimation of alignment parameters.
+
+[[!inline pages="tagged(LAST)" actions="no" limit=0]]