]> source.charles.plessy.org Git - source.git/commitdiff
Cellulose café
authorCharles <charles.plessy@oist.jp>
Thu, 24 Jan 2019 04:33:39 +0000 (13:33 +0900)
committerCharles <charles.plessy@oist.jp>
Thu, 24 Jan 2019 04:33:39 +0000 (13:33 +0900)
biblio/14740209.mdwn [new file with mode: 0644]
biblio/20335363.mdwn
biblio/20972815.mdwn
biblio/22792236.mdwn
tags/Oikopleura.mdwn

diff --git a/biblio/14740209.mdwn b/biblio/14740209.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..f9b97a1
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="The evolutionary origin of animal cellulose synthase."]]
+[[!tag Oikopleura cellulose]]
+
+Nakashima K, Yamada L, Satou Y, Azuma J, Satoh N.
+
+Dev Genes Evol. 2004 Feb;214(2):81-8.
+
+The evolutionary origin of animal cellulose synthase.
+
+[[!pmid 14740209 desc="The cellulose synthase genes in Tunicates are thought to be of actinobacterial origin, because the tunicate CesA gene contains two domains with similarity with a cellulose synthase and a cellulase of the glycoside hydrolase (GH)-6 family, and these genes are often found in proximity in actinobacteria."]]
index afde758d87ceee90a88f08adb9139e1f23523726..3ea8aa2bd1d11ac77286d372a32cbdaf5c31f84e 100644 (file)
@@ -1,5 +1,5 @@
 [[!meta title="Functional specialization of cellulose synthase genes of prokaryotic origin in chordate larvaceans."]]
-[[!tag Oikopleura]]
+[[!tag Oikopleura cellulose]]
 
 Development. 2010 May;137(9):1483-92. doi:10.1242/dev.044503
 
index 9f2f6951a8aa9c225a487b7a310c557b65c5a0b8..791f61ec320399e0b2819916b066a46d2553d40b 100644 (file)
@@ -1,5 +1,5 @@
 [[!meta title="The crystalline phase of cellulose changes under developmental control in a marine chordate."]]
-[[!tag Oikopleura]]
+[[!tag Oikopleura cellulose]]
 
 Cell Mol Life Sci. 2011 May;68(9):1623-31. doi:10.1007/s00018-010-0556-7
 
index a9e7c5feb323600e60b7bc60b4ae93440d59c651..8f579b7d214dfcc5a518da213b1023f4b370b8c6 100644 (file)
@@ -1,5 +1,5 @@
 [[!meta title="The evolving proteome of a complex extracellular matrix, the Oikopleura house."]]
-[[!tag Oikopleura]]
+[[!tag Oikopleura cellulose]]
 
 PLoS One. 2012;7(7):e40172. doi:10.1371/journal.pone.0040172
 
index 970284980e9f30d58d8e5e64c00135cd613e1b43..1f04403841eeed0db95f4e073a908b109a6d1e0f 100644 (file)
@@ -117,9 +117,11 @@ Genes and pathways
 
  - ~80 "house proteins" have been identified and more than half lack similarity
    to known proteins ([[Hosp et al., 2012|biblio/22792236]]).
- - 2 cellulose synthase genes were found by [[Sagane et al. (2010)|biblio/20335363]]
-   and [[Nakashima et al. (2011)|biblio/20972815]].  They are used to produce different
-   crystalline forms of cellulose ([[Nakashima et al., 2011|biblio/20972815]]).
+ - 2 cellulose synthase genes, possibly acquired by horizontal gene transfer
+   from an actinobacteria([[Nakashima and coll., 2004|biblio/14740209]]), were
+   found by [[Sagane et al. (2010)|biblio/20335363]] and [[Nakashima et al.
+   (2011)|biblio/20972815]].  They are used to produce different crystalline forms
+   of cellulose ([[Nakashima et al., 2011|biblio/20972815]]).
  - _O. dioica_ has multiple CDK1 and Cyclin B paraplogs, some of which are
    implicated in oogenesis ([[Feng & Thompson, 2018|biblio/29969934]]).
  - _O. dioica_ only has the Dnmt2 methyltransferase, and lacks Dnmt1 and Dnmt3.