]> source.charles.plessy.org Git - source.git/commitdiff
Plus de PubMed
authorCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Tue, 16 Jun 2020 01:15:39 +0000 (10:15 +0900)
committerCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Tue, 16 Jun 2020 01:15:39 +0000 (10:15 +0900)
open-source-biologist.mdwn

index e3efec949eddb4ebdb702e22a8f041f0eac6f9bf..8d78cffb0318428143396e29f1cb53239d34ea5b 100644 (file)
@@ -53,15 +53,16 @@ development and analysis, I have been a **member of the FANTOM consortium**
 since FANTOM3.
 
 Together with my colleagues at RIKEN and collaborators in the field of
-neuroscience, I have applied nanoCAGE to the study of single neuron
-cell types, for instance the **olfactory neurons** ([Plessy et al., 2012),
-or in dopaminergic cells, where we could demonstrate the expression of
-haemoglobin in the midbrain (Biagioli et al., 2009). We are also
-exploring the sub-cellular localisation of RNA in **Purkinje neurons**
-(Kratz et al., 2014), and neurogenesis in the mouse olfactory
-epithelium using single-cell CAGE and ATAC-seq techniques. In parallel
-with this promoter-centric work, I have also explored the huge
-repertoire of the **T cell antigen receptors**.
+neuroscience, I have applied nanoCAGE to the study of single neuron cell types,
+for instance the **olfactory neurons** ([Plessy and coll.,
+2012](https://pubmed.gov/22194471)), or in dopaminergic cells, where we could
+demonstrate the expression of haemoglobin in the midbrain ([Biagioli and coll.,
+2009](https://pubmed.gov/19717439)). We are also exploring the sub-cellular
+localisation of RNA in **Purkinje neurons** ([Kratz and coll.,
+2014](https://pubmed.gov/24904046)), and neurogenesis in the mouse olfactory
+epithelium using single-cell CAGE and ATAC-seq techniques. In parallel with
+this promoter-centric work, I have also explored the huge repertoire of the **T
+cell antigen receptors**.
 
 I joined OIST in 2018, to study **the genetic structure and population
 variations** of an animal plankton, Oikopleura dioica, that has a genome
@@ -71,7 +72,7 @@ World.
 
 I am also a **Free Software** enthusiast, and contribute to the Debian Med
 project, by **packaging bioinformatics tools**, which are redistributed in
-Debian (Möller et al., 2010) and its derivatives such as Ubuntu and
-(cloud)Bio-Linux. For digital signature of my contributions and other
-activities as a RIKEN researcher, I use the GPG key number
-B3443334. My ORCID ID is 0000-0001-7410-6295.
+Debian ([Möller and coll., 2010](https://pubmed.gov/21210984)) and its
+derivatives such as Ubuntu and (cloud)Bio-Linux. For digital signature of my
+contributions and other activities as a RIKEN researcher, I use the GPG key
+number B3443334. My ORCID ID is 0000-0001-7410-6295.