]> source.charles.plessy.org Git - source++/.git/commitdiff
Trans-splicing consensus site.
authorCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Mon, 2 May 2022 04:26:29 +0000 (13:26 +0900)
committerCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Mon, 2 May 2022 04:26:29 +0000 (13:26 +0900)
biblio/15314184.mdwn

index 7d63dcd1021976faec665ffaf038af59b2f82a2d..cb28db59bf950331ae8685f9558c35169af7211b 100644 (file)
@@ -7,4 +7,4 @@ Mol Cell Biol. 2004 Sep;24(17):7795-805. doi:10.1128/MCB.24.17.7795-7805.2004
 
 Spliced-Leader RNA trans Splicing in a Chordate, Oikopleura dioica, with a Compact Genome.
 
-[[!pmid 15314184 desc="5′ splice leader (SL) found in 90/158 ESTs containing a start codon.  The SL RNA is found downstream of the 5S RNA in at least 40 occurences, and aproximately 2/3 of all the 5S rRNA genes.  Its sequence is ACTCATCCCATTTTTGAGTCCGATTTCGATTGTCTAACAG. O. doica is the first chordate where gene operons have been described.  Intercistronic regions are very short (<30 nt)."]]
+[[!pmid 15314184 desc="5′ splice leader (SL) found in 90/158 ESTs containing a start codon.  The SL RNA is found downstream of the 5S RNA in at least 40 occurences, and aproximately 2/3 of all the 5S rRNA genes.  Its sequence is ACTCATCCCATTTTTGAGTCCGATTTCGATTGTCTAACAG. O. doica is the first chordate where gene operons have been described.  Intercistronic regions are very short (<30 nt).  “In comparing 52 distinct trans-splice acceptor sites to 605 cis-splice acceptor sites, the same consensus sequence, TTT(C/T/A)AG, was observed at both intron and intercistronic region 3′ ends. A notable difference from cis splicing was that most exons trans spliced to the leader (133 of 145) started with an adenosine, whereas the start of cis-spliced exons did not show any nucleotide preference”"]]