]> source.charles.plessy.org Git - source/.git/commitdiff
Pro-cap
authorCharles Plessy <plessy@riken.jp>
Thu, 1 Feb 2018 07:24:36 +0000 (16:24 +0900)
committerCharles Plessy <plessy@riken.jp>
Thu, 1 Feb 2018 07:24:36 +0000 (16:24 +0900)
tags/cap.mdwn

index 7442037c2a396dd6792c2fc4a4aa8d1f727d008f..082ef11bd2ae4b9b30a391c3f688947b0f8567fa 100644 (file)
@@ -4,6 +4,8 @@ Methods for enriching capped RNAs.
 
 (work in progress)
 
+ - See the Wikipedia for [[CAGE methods|https://en.wikipedia.org/wiki/Cap_analysis_gene_expression]] (Cap Analysis Gene Expression).
+
  - A method similar to oligo-capping was reported by [[Sekine and Kato|biblio/8247743]] in 1993.
 
  - Oligo-capping ([[Maruyama et al., 1994|biblio/8125298]]): dephosphorylate,
@@ -21,8 +23,12 @@ Methods for enriching capped RNAs.
    reads through the cap structure and chemical bond, and integrates the reverse
    complement of the oligonucleotide to the first-strand cDNA.
 
- - [[Cleptet et al., 2004|biblio/14704363]] modified oligo-capping, to use T4
+ - [[Clepet et al., 2004|biblio/14704363]] modified oligo-capping, to use T4
    DNA ligase and a double-stranded adapter with NNNNNN overhang instead of T4
    RNA ligase and a single-stranded linker.
 
+ - [[Kwak et al., 2013|biblio/23430654]] modified oligo-capping to create Pro-cap, a method for nuclear
+   run-on analysis at single-nucleotide resulution.
+
+
 [[!inline pages="tagged(cap)" limit=0]]