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authorCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Mon, 20 Jun 2022 06:50:00 +0000 (15:50 +0900)
committerCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Mon, 20 Jun 2022 06:50:00 +0000 (15:50 +0900)
biblio/10.1101_2020.03.16.993428.mdwn [deleted file]
biblio/34090340.mdwn [new file with mode: 0644]

diff --git a/biblio/10.1101_2020.03.16.993428.mdwn b/biblio/10.1101_2020.03.16.993428.mdwn
deleted file mode 100644 (file)
index f14b9cc..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,10 +0,0 @@
-[[!meta title="Overcoming uncollapsed haplotypes in long-read assemblies of non-model organisms"]]
-[[!tag bioRxiv assembly benchmark]]
-
-Nadège Guiglielmoni, Antoine Houtain, Alessandro Derzelle, Karine van Doninck, Jean-François Flot
-
-bioRxiv 2020.03.16.993428; doi: https://doi.org/10.1101/2020.03.16.993428 
-
-Overcoming uncollapsed haplotypes in long-read assemblies of non-model organisms
-
-[[!pmid 10.1101/2020.03.16.993428 desc="Benchark using a bdelloid rotifer.  Performance of most software plateaus over 50× depth. purge_dups performed well on Flye assemblies.  Filtering our shorter reads did not dramatically change the N50 of Flye 2.5 assemblies"]]
diff --git a/biblio/34090340.mdwn b/biblio/34090340.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..bc2ee06
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="Overcoming uncollapsed haplotypes in long-read assemblies of non-model organisms"]]
+[[!tag assembly benchmark]]
+
+Nadège Guiglielmoni, Antoine Houtain, Alessandro Derzelle, Karine van Doninck, Jean-François Flot
+
+BMC Bioinformatics. 2021 Jun 5;22(1):303. doi:10.1186/s12859-021-04118-3
+
+Overcoming uncollapsed haplotypes in long-read assemblies of non-model organisms
+
+[[!pmid 34090340 desc="Benchark using a bdelloid rotifer.  Performance of most software plateaus over 50× depth. purge_dups performed well on Flye assemblies.  Filtering our shorter reads did not dramatically change the N50 of Flye 2.5 assemblies"]]