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Bursaphelenchus okinawaensis
authorCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Fri, 10 Jun 2022 01:39:18 +0000 (10:39 +0900)
committerCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Fri, 10 Jun 2022 01:39:18 +0000 (10:39 +0900)
biblio/33093047.mdwn [new file with mode: 0644]
tags/nematode.mdwn

diff --git a/biblio/33093047.mdwn b/biblio/33093047.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..bf118d1
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="Telomere-to-Telomere Genome Assembly of _Bursaphelenchus okinawaensis_ Strain SH1."]]
+[[!tag nematode genome]]
+
+Sun S, Shinya R, Dayi M, Yoshida A, Sternberg PW, Kikuchi T.
+
+Microbiol Resour Announc. 2020 Oct 22;9(43):e01000-20. doi:10.1128/MRA.01000-20
+
+Telomere-to-Telomere Genome Assembly of _Bursaphelenchus okinawaensis_ Strain SH1.
+
+[[!pmid 33093047 desc="70 Mb genome, 6 chromosomes, enriched for repeats at the arms ends.  Hi-C contact map shows strong interaction between all the central regions of the chromosomes."]]
index b1d7870a1fc670edde1437705c97a5939e6fa981..8d95f5bbeee8410eb59d38ffd22e29ddb67c18d8 100644 (file)
@@ -45,4 +45,8 @@
    genome sequence is evloving towards effective haploidy ([[Abad and coll.,
    2008|biblio/18660804]]).
 
+ - _Bursaphelenchus okinawaensis_ has a genome of 70 Mb in 6 chromosomes of similar length.
+   The Hi-C contact map shows strong interaction between the centre of all chromosomes
+   ([[Sun and coll., 2020|biblio/33093047]]).
+
 [[!inline pages="tagged(nematode)" limit=0]]