]> source.charles.plessy.org Git - source.git/commitdiff
Café
authorCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Sat, 3 Jun 2023 00:52:02 +0000 (09:52 +0900)
committerCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Sat, 3 Jun 2023 00:52:02 +0000 (09:52 +0900)
biblio/11178265.mdwn [new file with mode: 0644]
tags/variants.mdwn

diff --git a/biblio/11178265.mdwn b/biblio/11178265.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..17aec71
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="Evidence for symmetric chromosomal inversions around the replication origin in bacteria."]]
+[[!tag variants bacteria]]
+
+Eisen JA, Heidelberg JF, White O, Salzberg SL.
+
+Genome Biol. 2000;1(6):RESEARCH0011. doi:10.1186/gb-2000-1-6-research0011
+
+Evidence for symmetric chromosomal inversions around the replication origin in bacteria.
+
+[[!pmid 11178265 desc="X-shaped pattern observed in line plots of pairwise comparisons between E. coli and V. cholerae, or Streptococcus or Mycobacterium species."]]
index 222faccd584e1cc073b82bb5203c3c816f7d1aca..a89e2583d2b5e64d268c39ec69c22caba4cb7fc5 100644 (file)
@@ -57,6 +57,9 @@ inversion in _D. buzzati_ ([[Delprat and coll, 2009|biblio/19936241]]).
 [[Kent and coll., 2003|biblio/14500911]] reported 2 inversions per Mbp in
 human/mouse comparisons, median length 814. 
 
+In bacteria, rearrangements have been reported to generate a X-shaped pattern
+in dot-plots by [[Eisen and coll (2000)|biblio/11178265]].
+
 ### Mechanism
 
 _Staggered breaks_ ([[Ranz and coll., 2007|bilbio/17550304]]) caused