]> source.charles.plessy.org Git - source.git/commitdiff
ketchup
authorCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Thu, 23 Aug 2018 01:11:24 +0000 (10:11 +0900)
committerCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Thu, 23 Aug 2018 01:11:24 +0000 (10:11 +0900)
biblio/30087105.mdwn [new file with mode: 0644]

diff --git a/biblio/30087105.mdwn b/biblio/30087105.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..ed9f085
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="Highly Contiguous Genome Assemblies of 15 Drosophila Species Generated Using Nanopore Sequencing."]]
+[[!tag Drosophila Nanopore assembly]]
+
+G3 (Bethesda). 2018 Aug 7. pii: g3.200160.2018. doi:10.1534/g3.118.200160
+
+Miller DE, Staber C, Zeitlinger J, Hawley RS.
+
+Highly Contiguous Genome Assemblies of 15 Drosophila Species Generated Using Nanopore Sequencing.
+
+[[!pmid 30087105 desc="29× coverage and N50 of 4.4. Mb in average.  A multiplexed NextSeq 500 run was used for polishing.  Optimisation of Nanopore throughput by reorganising pore groups periodically, extracting high molecular weight DNA with phenol/chloroform extration, and using more DNA in the library preparation.  Benchmark of various tools including minimap/miniasm and canu."]]