]> source.charles.plessy.org Git - source.git/commitdiff
Café
authorCharles <charles.plessy@oist.jp>
Thu, 10 Jan 2019 04:46:56 +0000 (13:46 +0900)
committerCharles <charles.plessy@oist.jp>
Thu, 10 Jan 2019 04:46:56 +0000 (13:46 +0900)
biblio/26059717.mdwn
tags/assembly.mdwn

index 7e725d2f8f2ab6cd25702f4a7e4fc3c2a9e441d4..5ad2a2b668661a0ae74fd88c22c43ab449e1fbcb 100644 (file)
@@ -1,6 +1,8 @@
 [[!meta title="BUSCO: assessing genome assembly and annotation completeness with single-copy orthologs."]]
 [[!tag assembly]]
 
+Simão FA, Waterhouse RM, Ioannidis P, Kriventseva EV, Zdobnov EM.
+
 Bioinformatics. 2015 Oct 1;31(19):3210-2. doi:10.1093/bioinformatics/btv351
 
 BUSCO: assessing genome assembly and annotation completeness with single-copy orthologs.
index 4a703d7cd9e1798175d86c12f9d234c89be4777d..b1daa021f919ac7d5584fab570165bd74ede52ae 100644 (file)
@@ -7,4 +7,8 @@ _In progress..._
 The HaploMerger2 pipeline ([[Huang and coll., 2017|biblio/28407147]]) takes a diploid
 assembly and outputs a reference and an alternative assembly for each haplotype.
 
+BUSCO ([[Simão and coll., 2015|biblio/26059717]]), ([[Waterhouse and coll.,
+2017|29220515]]) assesses the presence of evolutionary conserved single-copy
+genes in the assemblies.
+
 [[!inline pages="tagged(assembly)" actions="no" limit=0]]