]> source.charles.plessy.org Git - source/.git/commitdiff
correction
authorCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Wed, 8 May 2019 07:15:54 +0000 (16:15 +0900)
committerCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Wed, 8 May 2019 07:15:54 +0000 (16:15 +0900)
tags/assembly.mdwn

index db55c0ffcf3b06fe0a623a4a7abf2c27bbee4570..f244ca890fd3fc4b8018f62f1a81b7dc9ef9b3f0 100644 (file)
@@ -8,13 +8,12 @@ Prior assembly, MinIONQC ([[Lanfear and coll., 2018|biblio/30052755]]) allows
 for the comparison of multiple Nanopore runs on the same plot, to assess if
 read length is satisfactory.
 
-The Flye assembler ([[Kolmogorov and coll, bioRxiv
-2018|biblio/30936562]]) creates an A-Bruijn (assembly) graph from draft
-contigs using long error-prone reads, untangles the graph by resolving repeats,
-and then uses it to refine the contings and increase their accuracy.  (The
-predecessor of Flye, ABruijn, was reported by [[Istace and coll.
-(2017)|biblio/28369459]] to be able to assemble mitochondrial genomes, unlike
-Canu and other assemblers.)
+The Flye assembler ([[Kolmogorov and coll. (2018)|biblio/30936562]]) creates an
+A-Bruijn (assembly) graph from draft contigs using long error-prone reads,
+untangles the graph by resolving repeats, and then uses it to refine the
+contings and increase their accuracy.  (The predecessor of Flye, ABruijn, was
+reported by [[Istace and coll.  (2017)|biblio/28369459]] to be able to assemble
+mitochondrial genomes, unlike Canu and other assemblers.)
 
 After assembly, the contigs can be further polished with Racon ([[Vaser, Sović,
 Nagarajan and Šikić, 2017|biblio/28100585]]).