]> source.charles.plessy.org Git - source.git/commitdiff
BUSCO
authorCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Thu, 23 Aug 2018 04:02:48 +0000 (13:02 +0900)
committerCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Thu, 23 Aug 2018 04:02:48 +0000 (13:02 +0900)
biblio/26059717.mdwn [new file with mode: 0644]
biblio/29220515.mdwn [new file with mode: 0644]

diff --git a/biblio/26059717.mdwn b/biblio/26059717.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..7e725d2
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,8 @@
+[[!meta title="BUSCO: assessing genome assembly and annotation completeness with single-copy orthologs."]]
+[[!tag assembly]]
+
+Bioinformatics. 2015 Oct 1;31(19):3210-2. doi:10.1093/bioinformatics/btv351
+
+BUSCO: assessing genome assembly and annotation completeness with single-copy orthologs.
+
+[[!pmid 26059717 desc="Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs. Can be used to train predictors such as Augustus."]]
diff --git a/biblio/29220515.mdwn b/biblio/29220515.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..342e62b
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="BUSCO applications from quality assessments to gene prediction and phylogenomics."]]
+[[!tag assembly]]
+
+Waterhouse RM, Seppey M, Simão FA, Manni M, Ioannidis P, Klioutchnikov G, Kriventseva EV, Zdobnov EM.
+
+Mol Biol Evol. 2017 Dec 6. doi:10.1093/molbev/msx319
+
+BUSCO applications from quality assessments to gene prediction and phylogenomics.
+
+[[!pmid 29220515 desc="BUSCO v3 and examples of use."]]