]> source.charles.plessy.org Git - setup/.git/commitdiff
Café
authorCharles <charles.plessy@oist.jp>
Fri, 4 Jun 2021 04:57:38 +0000 (13:57 +0900)
committerCharles <charles.plessy@oist.jp>
Fri, 4 Jun 2021 04:57:38 +0000 (13:57 +0900)
biblio/32808665.mdwn [new file with mode: 0644]

diff --git a/biblio/32808665.mdwn b/biblio/32808665.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..56c7204
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="A haplotype-resolved, de novo genome assembly for the wood tiger moth (Arctia plantaginis) through trio binning."]]
+[[!tag genome population haplotype]]
+
+Yen EC, McCarthy SA, Galarza JA, Generalovic TN, Pelan S, Nguyen P, Meier JI, Warren IA, Mappes J, Durbin R, Jiggins CD.
+
+Gigascience. 2020 Aug 1;9(8):giaa088. doi:10.1093/gigascience/giaa088
+
+A haplotype-resolved, de novo genome assembly for the wood tiger moth (Arctia plantaginis) through trio binning.
+
+[[!pmid 32808665 desc="“Heterozygosity of the F1 offspring was estimated to be ∼1.9%”  “the 2 scaffolded assemblies [were concatenated], mapped the 10X Illumina data [...], called variants [...], then applied homozygous non-reference edits to the assembly using bcftools consensus.”  “Assemblytics detected 32,203 SVs between the haplotype assemblies, affecting 51.6 Mb of the genome”"]]