]> source.charles.plessy.org Git - source.git/commitdiff
RNA captor
authorCharles <charles.plessy@oist.jp>
Fri, 8 Mar 2019 04:52:14 +0000 (13:52 +0900)
committerCharles <charles.plessy@oist.jp>
Fri, 8 Mar 2019 04:52:14 +0000 (13:52 +0900)
biblio/21533245.mdwn [new file with mode: 0644]
tags/cap.mdwn

diff --git a/biblio/21533245.mdwn b/biblio/21533245.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..dd6a5b5
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="RNA captor: a tool for RNA characterization."]]
+[[!tag cap library method]]
+
+Clepet C.
+
+PLoS One. 2011 Apr 13;6(4):e18445. doi:10.1371/journal.pone.0018445
+
+RNA captor: a tool for RNA characterization.
+
+[[!pmid 21533245 desc="Modified oligo-capping reaction using T4 RNA ligase 2 and a double-stranded adaptor with a 5′-protrusive NNN end and a  3′-amine blocking group on the other end of the same oligonucleotide."]]
index 6e01b644389a7f5c34925f9b31a8816ab850e9e8..e3333e7cd6ad174b71b34e5d0e67efe99cfea84c 100644 (file)
@@ -37,6 +37,11 @@ Methods for enriching capped RNAs
    DNA ligase and a double-stranded adapter with NNNNNN overhang instead of T4
    RNA ligase and a single-stranded linker.
 
+ - RNA captor ([[Clepet, 2011|biblio/21533245]]): a modified oligo-capping using
+   T4 RNA ligase 2 and a double-stranded adaptor.  The shorter oligonucleotide in
+   the adaptor is blocked by an amine group on its 3′ end, and protrudes with 3
+   random bases (NNN) on its 5′ end.
+
  - [[Kwak et al., 2013|biblio/23430654]] modified oligo-capping to create Pro-cap, a method for nuclear
    run-on analysis at single-nucleotide resulution.