]> source.charles.plessy.org Git - source/.git/commitdiff
eDNA
authorCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Wed, 25 Mar 2020 07:16:31 +0000 (16:16 +0900)
committerCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Wed, 25 Mar 2020 07:16:31 +0000 (16:16 +0900)
biblio/31937756.mdwn [new file with mode: 0644]
tags/Oikopleura.mdwn
tags/eDNA.mdwn

diff --git a/biblio/31937756.mdwn b/biblio/31937756.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..6fe6ecc
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,12 @@
+[[!meta title="Environmental DNA reveals seasonal shifts and potential interactions in a marine community."]]
+[[!tag Oikopleura eDNA]]
+
+Djurhuus A, Closek CJ, Kelly RP, Pitz KJ, Michisaki RP, Starks HA, Walz KR,
+Andruszkiewicz EA, Olesin E, Hubbard K, Montes E, Otis D, Muller-Karger FE,
+Chavez FP, Boehm AB, Breitbart M.
+
+Nat Commun. 2020 Jan 14;11(1):254. doi: 10.1038/s41467-019-14105-1.
+
+Environmental DNA reveals seasonal shifts and potential interactions in a marine community.
+
+[[!pmid desc="Found Oikopleura 18S sequences in MiSeq run SRR8473276."]]
index 7a05fba5c9d015436efeb6005987efc7ac6bb58d..20406bdb674bd70d3ff61fefb643089ed7041b04 100644 (file)
@@ -557,7 +557,8 @@ Ecology
 
  - California  ([[C. Essenbergm, 1922|biblio/1929090]]); rare in summer's warm
    (> 20ºC) waters and more abundant in winter's cool (13~16 ºC) waters.
- -  Throurought the North Pacific ([[Tokioka, 1960|biblio/10.5134_174644]]).
+ - Also found in eDNA form Monterey bay ([[Djurhuus and coll., 2020|biblio/31937756]]).
+ - Throurought the North Pacific ([[Tokioka, 1960|biblio/10.5134_174644]]).
  - Alaska, where it is more abundant in summer and near the coast ([[Doubleday
    and Hopcroft, 2015|biblio/10.1093_plankt_fbu092]]).
  - Giant appendicularians could be observed in high abundance from deep submersibles
index 0d5ce17ec733d74bfe18b82c66344a9c064440ad..8187c113772ab992f2f06f249f0f631782e37a09 100644 (file)
@@ -2,5 +2,7 @@
 
  - Oikopleura detected in 18S rRNA amplified with universal primers:
    [[Berry and coll., 2019|biblio/30735490]].
+ - Oikopleura 18S detected in at least one MiSeq run from
+   [[Djurhuus and coll. 2020|biblio/31937756]]
 
 [[!inline pages="tagged(eDNA)" limit=0]]