]> source.charles.plessy.org Git - source/.git/commitdiff
Old
authorCharles Plessy <plessy@riken.jp>
Thu, 1 Feb 2018 01:21:42 +0000 (10:21 +0900)
committerCharles Plessy <plessy@riken.jp>
Thu, 1 Feb 2018 01:21:42 +0000 (10:21 +0900)
biblio/20543846.mdwn
biblio/22362160.mdwn [new file with mode: 0644]
tags/EcoP15I.mdwn

index dbc95cfbe2a6ba9680cdc3a2968f633072f73e1c..c3e763df3c5fc3b6eeed56a422a2d02dd96db12e 100644 (file)
@@ -1,3 +1,3 @@
 [[!meta title="Linking promoters to functional transcripts in small samples with nanoCAGE and CAGEscan."]]
-[[!tag sequence_tags cap EcoP15I]]
+[[!tag sequence_tags cap EcoP15I nanoCAGE]]
 [[!pmid 20543846 desc="nanoCAGE and CAGEscan with read length of 36 bases."]]
diff --git a/biblio/22362160.mdwn b/biblio/22362160.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..9a8ad8c
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="5' end-centered expression profiling using cap-analysis gene expression and next-generation sequencing."]]
+[[!tag sequence_tags CAGE EcoP15I]]
+
+Nat Protoc. 2012 Feb 23;7(3):542-61. doi:10.1038/nprot.2012.005
+
+Takahashi H, Lassmann T, Murata M, Carninci P.
+
+5' end-centered expression profiling using cap-analysis gene expression and next-generation sequencing.
+
+[[!pmid 22362160 desc="CAGE version with EcoP15I cleavage."]]
index cd37927162834cb2c36655274ce434a373ca8379..7b3104fd6d309e77ace11115e5c9ef86f73865d8 100644 (file)
@@ -7,4 +7,6 @@ A few facts about EcoP15I
  - Positive bias for adenine stretches on the 5′ or 3′ side of CAGCAG [[Möncke-Buchner et al., 2009|biblio/19250940]].
  - Stimulated by AdoMet and sinefungin [[Raghavendra & Rao, 2005|biblio/16026759]].
 
+Used in [[SuperSAGE|biblio/14676315]], [[HELP-tagging|biblio/20359321]], [[nanoCAGE|biblio/20543846]], [[CAGE|biblio/22362160]].  (non-exhaustive list)
+
 [[!inline pages="tagged(EcoP15I)" actions="no" limit=0]]