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authorCharles <charles.plessy@oist.jp>
Mon, 13 Jul 2020 05:11:05 +0000 (14:11 +0900)
committerCharles <charles.plessy@oist.jp>
Mon, 13 Jul 2020 05:11:05 +0000 (14:11 +0900)
biblio/32619237.mdwn [new file with mode: 0644]

diff --git a/biblio/32619237.mdwn b/biblio/32619237.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..62de025
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,12 @@
+[[!meta title="Embryonic tissue differentiation is characterized by transitions in cell cycle dynamic-
+associated core promoter regulation."]]
+[[!tag CAGE zebrafish cell_cycle promoter]]
+
+Nucleic Acids Res. 2020 Jul 3:gkaa563. doi:10.1093/nar/gkaa563
+
+Wragg JW, Roos L, Vucenovic D, Cvetesic N, Lenhard B, Müller F.
+
+Embryonic tissue differentiation is characterized by transitions in cell cycle dynamic-
+associated core promoter regulation.
+
+[[!pmid 32619237 desc="“TATA-box enrichment in genes upregulated in G1 (∼30 bp upstream of the TSS), but no enrichment in WW dinucleotide frequency between the G1 and S/G2/M differentially expressed gene sets.”  “Four TATA-divergent poly-W pentamers (TTAAA, TAAAT, TTTAA, AATAA) were significantly enriched (P < 0.001–0.01) in the promoters of genes upregulated in S/G2/M cells.”  “TATA-box utilization is highly enriched in sharp promoters over other behaviours, interestingly however this is only true in the gene set upregulated in G1. In the S/G2/M upregulated gene set promoter shape was only weakly associated with TATA utilization.”"]]