]> source.charles.plessy.org Git - source/.git/commitdiff
Café
authorCharles <charles.plessy@oist.jp>
Thu, 17 Sep 2020 06:31:54 +0000 (15:31 +0900)
committerCharles <charles.plessy@oist.jp>
Thu, 17 Sep 2020 06:31:54 +0000 (15:31 +0900)
biblio/29330139.mdwn [new file with mode: 0644]
tags/Oikopleura.mdwn

diff --git a/biblio/29330139.mdwn b/biblio/29330139.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..79ea63b
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="Phylogenomics offers resolution of major tunicate relationships."]]
+[[!tag Oikopleura tunicate evolution]]
+
+Kocot KM, Tassia MG, Halanych KM, Swalla BJ.
+
+Mol Phylogenet Evol. 2018 Apr;121:166-173. doi:10.1016/j.ympev.2018.01.005
+
+Phylogenomics offers resolution of major tunicate relationships.
+
+[[!pmid 29330139 desc="A matrix of 798 genes totaling 254,865 amino acid positions places appendicularians as the sister group to all other tunicates."]]
index ce6665c1b422d982ee5d0a9ebe15e2a6f5e0568f..66ac8c68ba9e31bf257230aa98a0abf8425f9eb5 100644 (file)
@@ -38,8 +38,9 @@ Phylogeny
    clade is sister of Stolidobranchia (that is, not basal in Tunicates).
    Stolidobranchia.  Nevertheless, it might be an artefact of AT-richness or
    long-branch attraction ([[Tsagkogeorga et al, 2009|biblio/19656395]]).
- - Studies based on 146 genes in 28 species ([[Delsuc et al., 2006|biblio/16495997]])
-   and then 258 orthologous proteins from 63 species ([[Delsuc et al., 2018|biblio/29653534]])
+ - Studies based on 146 genes in 28 species ([[Delsuc et al., 2006|biblio/16495997]]),
+   on 798 genes in 28 species ([[Kocot and coll., 2018|biblio/29330139]]),
+   and 258 orthologous proteins from 63 species ([[Delsuc et al., 2018|biblio/29653534]])
    show that Oikopleuridae is sister to all other tunicates.
  - “The difference between coding sequences was considerably higher in
    comparisons between strains of different oceans than within the Bergen gene