]> source.charles.plessy.org Git - source/.git/commitdiff
O. dioica's mitochondrial sequences.
authorCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Fri, 30 Aug 2019 04:51:02 +0000 (13:51 +0900)
committerCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Fri, 30 Aug 2019 04:51:02 +0000 (13:51 +0900)
tags/mitochondrion.mdwn

index a523aac32d971d0385595240c4618bf1ff59cc20..bf68f92cbc6f3c19e7aeebe453e396416f826505 100644 (file)
@@ -30,6 +30,8 @@ https://en.wikipedia.org/wiki/Ascidian_mitochondrial_code
  - Sequence of a thaliacean (_Doliolum nationalis_) mitochondrial genome
    suggests they also decode AGR as glycine ([[Yokobori, Oshima and Wada,
    2005|biblio/15619441]]).
+ - [[Deneoud and coll, 2010|biblio/21097902]] reported that mitochondrial
+   genes of _O. dioica_ translate well with the ascidian code.
  - Another case, unrelated, of reassignment to glycin is know: UGA → Gly in
    SR1 bacteria ([[Campbell and coll, 2013|biblio/23509275]]).
  - In the hemichordate _Balanoglossus carnosus_ ([[Castresana and coll.,
@@ -38,8 +40,9 @@ https://en.wikipedia.org/wiki/Ascidian_mitochondrial_code
 ```
                      AGA   AGG   ATA   AAA   TGA
 Vertebrates           *     *     M     K     W
-Tunicates             G     G     M     K     W
-Cephalochordates
+Tunicates             G     G     M     K     W   (O. di, salps, ascidians)
+ O. lon and B. char?  G     G     I     K     W
+Cephalochordates      S    S,ø?   M     K     W   (standard invertebrate)
 Hemichordates         S     ø     I     ø     W
 Echinoderms           S     S     I     N     W
 ```