]> source.charles.plessy.org Git - source.git/commitdiff
Café
authorCharles <charles.plessy@oist.jp>
Fri, 11 Jan 2019 06:20:20 +0000 (15:20 +0900)
committerCharles <charles.plessy@oist.jp>
Fri, 11 Jan 2019 06:20:20 +0000 (15:20 +0900)
biblio/30052755.mdwn [new file with mode: 0644]
tags/assembly.mdwn

diff --git a/biblio/30052755.mdwn b/biblio/30052755.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..d8df28a
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="MinIONQC: fast and simple quality control for MinION sequencing data."]]
+[[!tag Nanopore assembly]]
+
+Lanfear R, Schalamun M, Kainer D, Wang W, Schwessinger B.
+
+Bioinformatics. 2018 Jul 23. doi:10.1093/bioinformatics/bty654
+
+MinIONQC: fast and simple quality control for MinION sequencing data.
+
+[[!pmid 30052755 desc="Allows for comparison of multiple runs on the same plot."]]
index 28eed85bb5307080da7d7b4b2ffd8ed7113a6014..10572045f9c3d84e323b76041a03b9027bbacc86 100644 (file)
@@ -4,6 +4,10 @@
 
 _In progress..._
 
+Prior assembly, MinIONQC ([[Lanfear and coll., 2018|biblio/30052755]]) allows
+for the comparison of multiple Nanopore runs on the same plot, to assess if
+read length is satisfactory.
+
 The HaploMerger2 pipeline ([[Huang and coll., 2017|biblio/28407147]]) takes a diploid
 assembly and outputs a reference and an alternative assembly for each haplotype.