]> source.charles.plessy.org Git - setup/.git/commitdiff
Omura bay and reorganisation
authorCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Wed, 11 Sep 2019 00:59:38 +0000 (09:59 +0900)
committerCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Wed, 11 Sep 2019 00:59:38 +0000 (09:59 +0900)
biblio/10069_30542.mdwn [new file with mode: 0644]
tags/Oikopleura.mdwn

diff --git a/biblio/10069_30542.mdwn b/biblio/10069_30542.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..94c73c8
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,12 @@
+[[!meta title="Studies on the Zooplankton in Omura Bay―II Seasonal Occurrences of Rotatoria, Cladocera, Sagittoidea, Appendiculata and Benthos Larvae"]]
+[[!tag Oikopleura]]
+
+伊藤,栄樹/飯塚,昭二 (Itoh, Hideki / Iizuka, Shoji)
+
+大村湾における動物プランクトンに関する研究―II 輪虫類,枝角類,矢虫類,尾虫類 および底生生物幼生の季節的出現
+
+Studies on the Zooplankton in Omura Bay―II Seasonal Occurrences of Rotatoria, Cladocera, Sagittoidea, Appendiculata and Benthos Larvae
+
+長崎大学水産学部研究報告, v.49, pp.1-10; 1980
+
+[[!handle 10069/30542 desc="O. dioica found in the Omura (Nagasaki) bay."]]
index c21eb5c921dfe161e435c33fb94056fd1a3818ec..116075fa7ee09f6d7fa3b357b50174e66d01fab5 100644 (file)
@@ -404,33 +404,20 @@ Ecology
 -------
 
  - _O. dioica_ grazes on bacterioplankton, which can be a significant share
-    of its own diet, but the grazing has only “minimal influence on the
-    population dynamics of the free-living bacteria” ([[King, Hollibaugh and
-    Azam, 1980|biblio/10.1007_BF00390593]])
- - In a rRNA metabarcoding study [[López-Escardó and coll, 2018|biblio/29904074]] report that 28 %
-   of the RNA reads in oxic micro/mesoplanktonic samples originate from tunicates, mostly appendicularian.
+   of its own diet, but the grazing has only “minimal influence on the
+   population dynamics of the free-living bacteria” ([[King, Hollibaugh and
+   Azam, 1980|biblio/10.1007_BF00390593]])
+ - In a rRNA metabarcoding study [[López-Escardó and coll,
+   2018|biblio/29904074]] report that 28 % of the RNA reads in oxic
+   micro/mesoplanktonic samples originate from tunicates, mostly appendicularian.
  - _O. dioica_ populations may have a higher fitness in warmer and more acid oceans
    ([[Bouquet et al., 2018|biblio/29298334]]).  Another mesocosm study that took place
    in the Gullmar Fjord ([[Algueró-Muñiz M and coll., 2017|biblio/28410436]])
    did not predict major changes in mesozooplankton community structure and provides raw data
    including _O. dioica_, for which no significant changes are visible.
- - In California, _O. dioica_ was reported by C. Essenberg
-   ([[1922|biblio/1929090]]) to be rare in summer's warm (> 20ºC) waters and
-   more abundant in winter's cool (13~16 ºC) waters.
- - _O. dioica_ was found throurought the North Pacific by ([[Tokioka (1960)|biblio/10.5134_174644]]).
  - _O. dioica_ has “a very large mutation rate, and/or a very large effective
    population size” ([[Denoeud et al., 2010|biblio/21097902]], according to a study
    of silent and non-silent substitution rates in coding sequences).
- - It was already reported to be frequent in Japanese waters [[in 1907 by T. Aida|biblio/AA0069577]].
- - _O. dioica_ was found all year in the Fukuyama harbour, Japan in 1986—7
-   [[Uye and Ichino, 1995|biblio/10.1016_0022-0981_95_00004-B]]).  Mature stages were also
-   found all year, and trunk length was shorter in summer.
- - In 1972, 1976, 1977, 1978, 1982 or 1986, _O. dioica_ was rare but relatively
-   more abundant in slope waters, compared with Kuroshio and subtropical
-   waters, on the Pacific side of the Japan coast ([[Hidaka,
-   2008|biblio/10.3800_pbr.3.152]]).
- - Two blooms taking place in summer 1997 in the Seto inland sea, Japan, were reported
-   by [[Nakamura (1998)|biblio/10.1023_A_1003531812536]].
  - Meta-transcriptomic analysis in the Red sea showed a decrease of appendicularians during
    a Trichodesmium bloom in 2012 ([[Mojib and coll., 2017|biblio/10.1002_lno.10395]]).
  - As of August 2018, _O. dioica_ is not yet found in the [BOLD](http://www.boldsystems.org/)
@@ -438,9 +425,6 @@ Ecology
  - Carbon output of _O. dioica_ is either their house or fecal pellets, the
    ratio of which may depend on food concentration ([[Acuña and
    Kiefer, 2000|biblio/10.4319_lo.2000.45.3.0608.mdwn]]).
- - Oikopleuridae can be found in the deep see.  For instance, [[Lindsay and
-   coll., 2014|biblio/10.1007_978-4-431-54865-2_51]] reported _Oikopleura_, _Mesochordaeus_
-   and _Bathochordaeus_ individuals in the Hatoma Knoll hydrothermal vent, Okinawa Trough.
  - Gravid _B mcnutti_ individuals are found at down to 800 m, but spawning is supposed to
    happen closer to the surface ([[Sherlock and coll., 2017|biblio/28042175]]).
  - Oikopleuridae have been reported to be able to ingest microplastics.  Example(s):
@@ -448,13 +432,28 @@ Ecology
  - _O. dioica_ can filter, ingest and defecate the _Emiliania huxleyi_ virus
    ([[Lawrence and coll., 2017|biblio/10.1002_lno.10734]]).  This study does not assess
    whether the viruses are digested.
- - While _O. dioica_ was not reported on the atlantic and pacific coasts of Costa Rica, its
-   presence is considered plausible ([[Castellanos, Morales-Ramírez and Suárez-Morales,
-   2009|biblio/10.1007_978-1-4020-8278-8_41]]).
- - _O. dioica_ and _O. longicauda_ were found throurought 2006-2007 in the Yellow sea
-   ([[Franco, Chen and Li, 2014|biblio/10.1007_s11802-014-2376-0]]).  Abundance peaked
-   is spring, but the animals could also be found in winter when water temperature
-   went below 10°C.
+
+### Distribution near Japan
+
+ - _O. dioica_ was reported in the Omura (Nagasaki) bay by [[Ito and Iizuka
+   (1980)|biblio/10069_30542]].
+ - It was already reported to be frequent in Japanese waters [[in 1907 by T.
+   Aida|biblio/AA0069577]].
+ - Oikopleuridae can be found in the deep see.  For instance, [[Lindsay and
+   coll., 2014|biblio/10.1007_978-4-431-54865-2_51]] reported _Oikopleura_, _Mesochordaeus_
+   and _Bathochordaeus_ individuals in the Hatoma Knoll hydrothermal vent, Okinawa Trough.
+ - Two blooms taking place in summer 1997 in the Seto inland sea, Japan, were reported
+   by [[Nakamura (1998)|biblio/10.1023_A_1003531812536]].
+ - _O. dioica_ was found all year in the Fukuyama harbour, Japan in 1986—7
+   [[Uye and Ichino, 1995|biblio/10.1016_0022-0981_95_00004-B]]).  Mature stages were also
+   found all year, and trunk length was shorter in summer.
+ - In 1972, 1976, 1977, 1978, 1982 or 1986, _O. dioica_ was rare but relatively
+   more abundant in slope waters, compared with Kuroshio and subtropical
+   waters, on the Pacific side of the Japan coast ([[Hidaka,
+   2008|biblio/10.3800_pbr.3.152]]).
+
+### Distribution near Taiwan and China
+
  - In Taiwan, _O. dioica_ was reported in north east costal waters in summar
    2005 by [[Hsiao and coll.|biblio/10.1007/s10750-011-0628-1]] and in 2009
    (plus near the Kueishan island) by [[Kâ and Hwang,
@@ -466,11 +465,29 @@ Ecology
  - In the northern south China sea, _O. longicauda_ and _O. rufescens_ were
    reported to be more abundant than _O. dioica_ in 2006 by ([[Li and coll.,
    2012|biblio/10.1007_s13131-012-0243-7]]).
- - _O. dioica_ was reported in the bay of Bengal by [[Bhavanarayana and
-   Ganapati in 1972|biblio/10.1007_BF03045329]].
+ - _O. dioica_ and _O. longicauda_ were found throurought 2006-2007 in the Yellow sea
+   ([[Franco, Chen and Li, 2014|biblio/10.1007_s11802-014-2376-0]]).  Abundance peaked
+   is spring, but the animals could also be found in winter when water temperature
+   went below 10°C.
+
+### Elsewhere in the Pacific ocean
+
+ - In California, _O. dioica_ was reported by C. Essenberg
+   ([[1922|biblio/1929090]]) to be rare in summer's warm (> 20ºC) waters and
+   more abundant in winter's cool (13~16 ºC) waters.
+ - _O. dioica_ was found throurought the North Pacific by ([[Tokioka
+   (1960)|biblio/10.5134_174644]]).
  - _O. dioica_ was reported in Alaska, where it is more abundant in summer
    and near the coast ([[Doubleday and Hopcroft, 2015|biblio/10.1093_plankt_fbu092]]).
 
+### Elsewhere in the World
+
+ - _O. dioica_ was reported in the bay of Bengal by [[Bhavanarayana and
+   Ganapati in 1972|biblio/10.1007_BF03045329]].
+ - While _O. dioica_ was not reported on the atlantic and pacific coasts of Costa Rica, its
+   presence is considered plausible ([[Castellanos, Morales-Ramírez and Suárez-Morales,
+   2009|biblio/10.1007_978-1-4020-8278-8_41]]).
+
 Other appendicularians
 ----------------------