]> source.charles.plessy.org Git - source/.git/commitdiff
Café
authorCharles <charles.plessy@oist.jp>
Wed, 25 Aug 2021 00:07:31 +0000 (09:07 +0900)
committerCharles <charles.plessy@oist.jp>
Wed, 25 Aug 2021 00:07:31 +0000 (09:07 +0900)
biblio/34078885.mdwn [new file with mode: 0644]

diff --git a/biblio/34078885.mdwn b/biblio/34078885.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..b52040a
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="Discovery of widespread transcription initiation at microsatellites predictable by sequence-based deep neural network."]]
+[[!tag CAGE method fingerprint nanopore]]
+
+Discovery of widespread transcription initiation at microsatellites predictable by sequence-based deep neural network.
+
+Nat Commun. 2021 Jun 2;12(1):3297. doi:10.1038/s41467-021-23143-7
+
+Grapotte M, Saraswat M, Bessière C, Menichelli C, Ramilowski JA, Severin J, Hayashizaki Y, Itoh M, Tagami M, Murata M, Kojima-Ishiyama M, Noma S, Noguchi S, Kasukawa T, Hasegawa A, Suzuki H, Nishiyori-Sueki H, Frith MC; FANTOM consortium, Chatelain C, Carninci P, de Hoon MJL, Wasserman WW, Bréhélin L, Lecellier CH.
+
+[[!pmid 34078885 desc="Cap Trap RNA-seq (CTR) seq: sequencing of CAGE cDNAs on the Nanopore platform.  RT primers contain some Us and the DNA/RNA hybrids are digested with USER to shorten the tail.  A BBBBBBBB UMI is present."]]