]> source.charles.plessy.org Git - setup/.git/commitdiff
Café
authorCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Wed, 26 Jan 2022 02:52:53 +0000 (11:52 +0900)
committerCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Wed, 26 Jan 2022 02:52:53 +0000 (11:52 +0900)
biblio/34815308.mdwn [new file with mode: 0644]

diff --git a/biblio/34815308.mdwn b/biblio/34815308.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..8bb3849
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="Comprehensive determination of transcription start sites derived from all RNA polymerases using ReCappable-seq."]]
+[[!tag library method]]
+
+Yan B, Tzertzinis G, Schildkraut I, Ettwiller L.
+
+Genome Res. 2021 Nov 23. doi:10.1101/gr.275784.121
+
+Comprehensive determination of transcription start sites derived from all RNA polymerases using ReCappable-seq.
+
+[[!pmid 34815308 desc="5 µg of total RNAs was decapped with the the yeast scavenger decapping enzyme (yDcpS), and recapped with vaccinia capping enzyme (VCE) and a biotinylated guanosine.  Therefore the protocol enriches for capped, triphosphorylated, diphosphorylated, but not monophosphorylated RNAs.  A control library made on RNA dephosphorylated with CIP was used to infer if a TSS is driven by Pol II or Pol III.  The methyl-triphosphate cap of RN7SK resists to the CIP treatement and causes it to be incorrectly classified Pol II."]]