]> source.charles.plessy.org Git - source.git/commitdiff
Café
authorCharles <charles.plessy@oist.jp>
Tue, 8 Sep 2020 05:06:08 +0000 (14:06 +0900)
committerCharles <charles.plessy@oist.jp>
Tue, 8 Sep 2020 05:06:08 +0000 (14:06 +0900)
biblio/32313176.mdwn [new file with mode: 0644]
tags/synteny.mdwn

diff --git a/biblio/32313176.mdwn b/biblio/32313176.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..614e184
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+[[!meta title="Deeply conserved synteny resolves early events in vertebrate evolution."]]
+[[!tag evolution synteny chromosome]]
+
+Simakov O, Marlétaz F, Yue JX, O'Connell B, Jenkins J, Brandt A, Calef R, Tung CH, Huang TK, Schmutz J, Satoh N, Yu JK, Putnam NH, Green RE, Rokhsar DS.
+
+Nat Ecol Evol. 2020 Jun;4(6):820-830. doi:10.1038/s41559-020-1156-z
+
+Deeply conserved synteny resolves early events in vertebrate evolution.
+
+[[!pmid 32313176 desc="Most of the 19 amphioxus (lancelet) chromosomes directly correspond to one of the 17 ancestral chordate linkage groups.  Pattern of paralogue elimination show that autotetraploidy was followed by allotetraploidy in bony vertebrates."]]
index 9bd08b3affa5f4fa0ca0a0c2f71471122c77d62a..364c601e2d38d0210ea409f2633a7180f2a994c6 100644 (file)
@@ -9,7 +9,8 @@ were enriched near CTCF-binding events.
 distribution follows a power law and explain it with a model that requires
 breakpoints to be in open regions (ENCODE) interacting with each other (Hi-C).
 
-The ancestral chordate has 17 chromosomes according to [[Putnam and coll, 2008|biblio/18563158]].
+The ancestral chordate has 17 chromosomes according to amphioxus assemblies of
+[[Putnam and coll, 2008|biblio/18563158]] and [[Simakov and coll., 2020|biblio/32313176]].
 
 The ancestral amniote has 49 chromosomes according to [[Sacerdot and coll., 2018|biblio/30333059]].