]> source.charles.plessy.org Git - source--/.git/commitdiff
Assis dans un parc
authorCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Mon, 5 Jun 2023 02:08:52 +0000 (11:08 +0900)
committerCharles Plessy <charles.plessy@oist.jp>
Mon, 5 Jun 2023 02:08:52 +0000 (11:08 +0900)
biblio/11017076.mdwn [new file with mode: 0644]
tags/variants.mdwn

diff --git a/biblio/11017076.mdwn b/biblio/11017076.mdwn
new file mode 100644 (file)
index 0000000..a0bc955
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,15 @@
+[[!meta title="Genome rearrangement by replication-directed translocation."]]
+[[!tag bacteria variants]]
+
+Tillier ER, Collins RA
+
+Nat Genet. 2000 Oct;26(2):195-7. doi:10.1038/79918
+
+Genome rearrangement by replication-directed translocation.
+
+[[!pmid 11017076 desc="X-shaped patterns in whole-genome comparisons dot plots.
+“Single-gene inversions occurred at 12 of 44 boundaries [of repositioned blocks
+of genes] identified in _Chlamydia_, compared with only 13 local inversions
+adjacent to any of the 643 genes not at a boundary”  Proposes that
+origin-centered inversions caused by replication forks can generate the
+patterns."]]
index 285f087a8c277979974bea83d7f923ffd2bc0020..9826c13b87699b5f3fdf9f1ecd2dcce2a9577390 100644 (file)
@@ -58,10 +58,10 @@ inversion in _D. buzzati_ ([[Delprat and coll, 2009|biblio/19936241]]).
 human/mouse comparisons, median length 814. 
 
 In bacteria, rearrangements have been reported to generate a X-shaped pattern
-in dot-plots by [[Eisen and coll (2000)|biblio/11178265]].  The authors suggest
-that the patterns are generated by inversions centered on origins and termini.
-The prevalence of this phenomenon was confirmed by [[D'Iorio and Dewar,
-2022|biblio/36261227]].
+in dot-plots by [[Eisen and coll (2000)|biblio/11178265]] and [[Tillier and
+Collins (2000)|biblio/11017076]].  Both reports suggest that the patterns are
+generated by inversions centered on origins and termini.  The prevalence of
+this phenomenon was confirmed by [[D'Iorio and Dewar, 2022|biblio/36261227]].
 
 ### Mechanism